RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 SMAPO00193 183 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC4A3P48751 1232 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 LAPTM4BQ86VI4 370 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 CD46P15529 392 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 DDX11L8A8MPP1 907 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 C14orf37Q86TY3 774 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.36□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 POTEB3A0JP26 581 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 POTEBQ6S5H4 581 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 RDH13Q8NBN7 331 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 TBC1D2Q9BYX2 928 aa11.35□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 SLF2Q8IX21 1173 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-205ENST00000462042 NECTIN2Q92692 538 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 USP46P62068 366 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 GJA5P36382 358 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 STAC3Q96MF2 364 aa11.31□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.3□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 KDM4AO75164 1064 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 GCGRP47871 477 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 FLIIQ13045 1269 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGGTB-205ENST00000462042 SPTLC1O15269 473 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 HRO43593 1189 aa11.27□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC10A3P09131 477 aa11.26□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA8CPA6NN73 597 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 LRCH3Q96II8 777 aa11.24□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR14Q9BWN1 585 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.22□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF40O75150 1001 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.21□□□□□ -0.61
RABGGTB-205ENST00000462042 HOXA2O43364 376 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 CFHP08603 1231 aa11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM259Q4ZIN3 620 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 FDX1P10109 184 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFV2P19404 249 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 BANK1Q8NDB2 785 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP6V1AP38606 617 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 RFC5P40937 340 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 LILRB3O75022 631 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 ZMYND15Q9H091 742 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-205ENST00000462042 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP4CP60510 307 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 FUT2Q10981 343 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 WNT2BQ93097 391 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 MCM6Q14566 821 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 MTMR2Q13614 643 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 QPCTQ16769 361 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 APBB1O00213 710 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 SOCS7O14512 581 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 UBTFP17480 764 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 HRCP23327 699 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 Q3C1V9 767 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.09□□□□□ -0.63
RABGGTB-205ENST00000462042 BCAMP50895 628 aa11.08□□□□□ -0.64
RABGGTB-205ENST00000462042 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-205ENST00000462042 MORN1Q5T089 497 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-205ENST00000462042 CABLES1Q8TDN4 633 aa11.07□□□□□ -0.64
RABGGTB-205ENST00000462042 A6NJR5 290 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGGTB-205ENST00000462042 GUCA2AQ02747 115 aa11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms