RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.94■□□□□ 0.14
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.92■□□□□ 0.14
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-202ENST00000460041 E9PCH4 1651 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.89■□□□□ 0.13
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MSH6P52701 1360 aa15.86■□□□□ 0.13
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DIP2AQ14689 1571 aa15.85■□□□□ 0.13
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa15.81■□□□□ 0.12
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.78■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NUP155O75694 1391 aa15.77■□□□□ 0.12
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRPM2O94759 1503 aa15.77■□□□□ 0.11
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
HOXB-AS3-202ENST00000460041 POTEAQ6S8J7 498 aa15.74■□□□□ 0.11
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXB-AS3-202ENST00000460041 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SHPRHQ149N8 1683 aa15.73■□□□□ 0.11
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 PTPRUQ92729 1446 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.7■□□□□ 0.1
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa15.7■□□□□ 0.1
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 C14orf37Q86TY3 774 aa15.69■□□□□ 0.1
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa15.65■□□□□ 0.1
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HOXB-AS3-202ENST00000460041 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.63■□□□□ 0.09
HOXB-AS3-202ENST00000460041 METP08581 1390 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MST1RQ04912 1400 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NAIPQ13075 1403 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.62■□□□□ 0.09
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.61■□□□□ 0.09
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.6■□□□□ 0.09
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LAMC1P11047 1609 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PTCH1Q13635 1447 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPLO60437 1756 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HFM1A2PYH4 1435 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.55■□□□□ 0.08
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C1orf167Q5SNV9 1468 aa15.52■□□□□ 0.08
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RXRBP28702 533 aa15.51■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AFF2P51816 1311 aa15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRIM52Q96A61 297 aa15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IFT172Q9UG01 1749 aa15.47■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KNDC1Q76NI1 1749 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C8orf37Q96NL8 207 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ORAI2Q96SN7 254 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-202ENST00000460041 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EP400Q96L91 3159 aa15.43■□□□□ 0.06
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
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