RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.96■■■■□ 3.99
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFYVE9O95405 1425 aa39.95■■■■□ 3.99
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.93■■■■□ 3.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM94Q12767 1356 aa39.89■■■■□ 3.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa39.89■■■■□ 3.98
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOCS7O14512 581 aa39.85■■■■□ 3.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NWD1Q149M9 1564 aa39.84■■■■□ 3.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP39.84■■■■□ 3.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBX22Q9Y458 520 aa39.74■■■■□ 3.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM135BQ49AJ0 1406 aa39.72■■■■□ 3.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.7■■■■□ 3.95
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAIPQ13075 1403 aa39.68■■■■□ 3.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSH6P52701 1360 aa39.67■■■■□ 3.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa39.66■■■■□ 3.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIP2AQ14689 1571 aa39.66■■■■□ 3.94
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa39.6■■■■□ 3.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIK3R4Q99570 1358 aa39.59■■■■□ 3.93
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa39.55■■■■□ 3.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPM2O94759 1503 aa39.55■■■■□ 3.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLAIN2Q9P270 581 aa39.54■■■■□ 3.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HFM1A2PYH4 1435 aa39.54■■■■□ 3.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C14orf37Q86TY3 774 aa39.51■■■■□ 3.92
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLTCL1P53675 1640 aa39.51■■■■□ 3.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM52Q96A61 297 aa39.5■■■■□ 3.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa39.47■■■■□ 3.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa39.46■■■■□ 3.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa39.45■■■■□ 3.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRUQ92729 1446 aa39.45■■■■□ 3.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.41■■■■□ 3.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF1BO60333 1816 aa39.41■■■■□ 3.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa39.4■■■■□ 3.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CADPS2Q86UW7 1296 aa39.38■■■■□ 3.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATF3P18847 181 aa39.37■■■■□ 3.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHLPP1O60346 1717 aa39.37■■■■□ 3.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METP08581 1390 aa39.33■■■■□ 3.89
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JCADQ9P266 1359 aa39.26■■■■□ 3.88
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCCP43146 1447 aa39.24■■■■□ 3.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VGFO15240 615 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.2■■■■□ 3.87
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXD1Q16676 465 aa39.18■■■■□ 3.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRINP3Q76B58 766 aa39.15■■■■□ 3.86
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.13■■■■□ 3.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPLO60437 1756 aa39.11■■■■□ 3.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MST1RQ04912 1400 aa39.11■■■■□ 3.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.09■■■■□ 3.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.08■■■■□ 3.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.07■■■■□ 3.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POTEAQ6S8J7 498 aa39.07■■■■□ 3.85
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.07■■■■□ 3.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa39.07■■■■□ 3.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTCH1Q13635 1447 aa39.06■■■■□ 3.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHPRHQ149N8 1683 aa39.03■■■■□ 3.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.01■■■■□ 3.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRP6O75581 1613 aa38.99■■■■□ 3.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAG1Q86YV5 1406 aa38.98■■■■□ 3.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGL3Q3MIN7 710 aa38.98■■■■□ 3.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NHSL1Q5SYE7 1610 aa38.97■■■■□ 3.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa38.97■■■■□ 3.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.95■■■■□ 3.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa38.93■■■■□ 3.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa38.92■■■■□ 3.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf167Q5SNV9 1468 aa38.91■■■■□ 3.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFT172Q9UG01 1749 aa38.89■■■■□ 3.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP38.82■■■■□ 3.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ORAI2Q96SN7 254 aa38.79■■■■□ 3.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STK26Q9P289 416 aa38.79■■■■□ 3.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa38.79■■■■□ 3.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIK3C2GO75747 1445 aa38.78■■■■□ 3.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMC1P11047 1609 aa38.76■■■■□ 3.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNPLA6Q8IY17 1366 aa38.76■■■■□ 3.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TECPR2O15040 1411 aa38.75■■■■□ 3.79
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