RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
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RABGEF1-205ENST00000450873 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 EID1Q9Y6B2 187 aa15.64■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 SOCS7O14512 581 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 HSPA1LP34931 641 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.63■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 IDI1Q13907 227 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGRB3O60242 1522 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXD1Q16676 465 aa15.59■□□□□ 0.09
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RABGEF1-205ENST00000450873 TRPM2O94759 1503 aa15.56■□□□□ 0.08
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RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.51■□□□□ 0.07
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RABGEF1-205ENST00000450873 SLC26A8Q96RN1 970 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGEF1-205ENST00000450873 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
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RABGEF1-205ENST00000450873 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
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RABGEF1-205ENST00000450873 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.42■□□□□ 0.06
RABGEF1-205ENST00000450873 TBX22Q9Y458 520 aa15.42■□□□□ 0.06
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RABGEF1-205ENST00000450873 RGL3Q3MIN7 710 aa15.41■□□□□ 0.06
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RABGEF1-205ENST00000450873 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.39■□□□□ 0.05
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RABGEF1-205ENST00000450873 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
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RABGEF1-205ENST00000450873 METP08581 1390 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 SHPRHQ149N8 1683 aa15.22■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.21■□□□□ 0.03
RABGEF1-205ENST00000450873 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.2■□□□□ 0.02
RABGEF1-205ENST00000450873 BRINP3Q76B58 766 aa15.19■□□□□ 0.02
RABGEF1-205ENST00000450873 MST1RQ04912 1400 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-205ENST00000450873 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa15.18■□□□□ 0.02
RABGEF1-205ENST00000450873 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
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