RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450375.5

PARL-208, Transcript of presenilin associated rhomboid like, human

TSL 2

Gene PARL, Length 488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARL-208	ENST00000450375	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PARL-208	ENST00000450375	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PARL-208	ENST00000450375	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PARL-208	ENST00000450375	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PARL-208	ENST00000450375	TOM1	O60784	492 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PARL-208	ENST00000450375	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PARL-208	ENST00000450375	NAIP	Q13075	1403 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	TRIM52	Q96A61	297 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	13.62	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	HFM1	A2PYH4	1435 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	ZFYVE9	O95405	1425 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	KCNA6	P17658	529 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PARL-208	ENST00000450375	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	KIF1B	O60333	1816 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	TRPM2	O94759	1503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	TMEM94	Q12767	1356 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	CLTCL1	P53675	1640 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	HSPA1L	P34931	641 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	TBX22	Q9Y458	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	NWD1	Q149M9	1564 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	DIP2A	Q14689	1571 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	ALK	Q9UM73	1620 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PARL-208	ENST00000450375	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	MSH6	P52701	1360 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	PIK3R4	Q99570	1358 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	C14orf37	Q86TY3	774 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PARL-208	ENST00000450375	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	PPL	O60437	1756 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	PTPRU	Q92729	1446 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	ATF3	P18847	181 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	MET	P08581	1390 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	RGL3	Q3MIN7	710 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PARL-208	ENST00000450375	PHLPP1	O60346	1717 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PARL-208	ENST00000450375	ILDR2	Q71H61	639 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PARL-208	ENST00000450375	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PARL-208	ENST00000450375	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PARL-208	ENST00000450375	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PARL-208	ENST00000450375	DCC	P43146	1447 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PARL-208	ENST00000450375	IFT172	Q9UG01	1749 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PARL-208	ENST00000450375	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.34	□□□□□ -0.27
PARL-208	ENST00000450375	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	PTCH1	Q13635	1447 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	HRC	P23327	699 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		13.32	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	JCAD	Q9P266	1359 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	SOCS7	O14512	581 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	STK26	Q9P289	416 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	MST1R	Q04912	1400 aa		13.29	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	PIK3C2G	O75747	1445 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		13.28	□□□□□ -0.28
PARL-208	ENST00000450375	LAMC1	P11047	1609 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PARL-208	ENST00000450375	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
PARL-208	ENST00000450375	MYOM2	P54296	1465 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PARL-208	ENST00000450375	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		13.26	□□□□□ -0.29
PARL-208	ENST00000450375	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		13.25	□□□□□ -0.29
PARL-208	ENST00000450375	SHPRH	Q149N8	1683 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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