RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444999.5

UPP1-209, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 869 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-209ENST00000444999 ZFYVE9O95405 1425 aa28.32■■■□□ 2.12
UPP1-209ENST00000444999 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
UPP1-209ENST00000444999 ILDR2Q71H61 639 aa28.29■■■□□ 2.12
UPP1-209ENST00000444999 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.28■■■□□ 2.12
UPP1-209ENST00000444999 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
UPP1-209ENST00000444999 KCNA6P17658 529 aa28.27■■■□□ 2.12
UPP1-209ENST00000444999 BCANQ96GW7 911 aa28.27■■■□□ 2.12
UPP1-209ENST00000444999 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.24■■■□□ 2.11
UPP1-209ENST00000444999 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
UPP1-209ENST00000444999 NAIPQ13075 1403 aa28.22■■■□□ 2.11
UPP1-209ENST00000444999 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
UPP1-209ENST00000444999 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
UPP1-209ENST00000444999 TMEM94Q12767 1356 aa28.22■■■□□ 2.11
UPP1-209ENST00000444999 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
UPP1-209ENST00000444999 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
UPP1-209ENST00000444999 NWD1Q149M9 1564 aa28.18■■■□□ 2.1
UPP1-209ENST00000444999 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
UPP1-209ENST00000444999 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.14■■■□□ 2.1
UPP1-209ENST00000444999 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
UPP1-209ENST00000444999 TBX22Q9Y458 520 aa28.13■■■□□ 2.09
UPP1-209ENST00000444999 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.12■■■□□ 2.09
UPP1-209ENST00000444999 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
UPP1-209ENST00000444999 HFM1A2PYH4 1435 aa28.09■■■□□ 2.09
UPP1-209ENST00000444999 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
UPP1-209ENST00000444999 TRIM52Q96A61 297 aa28.06■■■□□ 2.08
UPP1-209ENST00000444999 CLTCL1P53675 1640 aa28.05■■■□□ 2.08
UPP1-209ENST00000444999 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.05■■■□□ 2.08
UPP1-209ENST00000444999 DIP2AQ14689 1571 aa28.03■■■□□ 2.08
UPP1-209ENST00000444999 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
UPP1-209ENST00000444999 TRPM2O94759 1503 aa28.02■■■□□ 2.08
UPP1-209ENST00000444999 MSH6P52701 1360 aa28.01■■■□□ 2.07
UPP1-209ENST00000444999 SOCS7O14512 581 aa28■■■□□ 2.07
UPP1-209ENST00000444999 PTPRUQ92729 1446 aa27.99■■■□□ 2.07
UPP1-209ENST00000444999 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.99■■■□□ 2.07
UPP1-209ENST00000444999 PIK3R4Q99570 1358 aa27.99■■■□□ 2.07
UPP1-209ENST00000444999 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.98■■■□□ 2.07
UPP1-209ENST00000444999 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
UPP1-209ENST00000444999 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.96■■■□□ 2.07
UPP1-209ENST00000444999 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.95■■■□□ 2.07
UPP1-209ENST00000444999 SLAIN2Q9P270 581 aa27.95■■■□□ 2.06
UPP1-209ENST00000444999 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.94■■■□□ 2.06
UPP1-209ENST00000444999 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.93■■■□□ 2.06
UPP1-209ENST00000444999 C14orf37Q86TY3 774 aa27.92■■■□□ 2.06
UPP1-209ENST00000444999 KIF1BO60333 1816 aa27.91■■■□□ 2.06
UPP1-209ENST00000444999 METP08581 1390 aa27.9■■■□□ 2.06
UPP1-209ENST00000444999 FOXD1Q16676 465 aa27.9■■■□□ 2.06
UPP1-209ENST00000444999 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
UPP1-209ENST00000444999 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
UPP1-209ENST00000444999 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.87■■■□□ 2.05
UPP1-209ENST00000444999 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
UPP1-209ENST00000444999 ATF3P18847 181 aa27.83■■■□□ 2.05
UPP1-209ENST00000444999 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.82■■■□□ 2.04
UPP1-209ENST00000444999 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.8■■■□□ 2.04
UPP1-209ENST00000444999 PHLPP1O60346 1717 aa27.8■■■□□ 2.04
UPP1-209ENST00000444999 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
UPP1-209ENST00000444999 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
UPP1-209ENST00000444999 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.77■■■□□ 2.04
UPP1-209ENST00000444999 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
UPP1-209ENST00000444999 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
UPP1-209ENST00000444999 PPLO60437 1756 aa27.73■■■□□ 2.03
UPP1-209ENST00000444999 DCCP43146 1447 aa27.73■■■□□ 2.03
UPP1-209ENST00000444999 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.72■■■□□ 2.03
UPP1-209ENST00000444999 BRINP3Q76B58 766 aa27.71■■■□□ 2.03
UPP1-209ENST00000444999 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.71■■■□□ 2.03
UPP1-209ENST00000444999 JCADQ9P266 1359 aa27.71■■■□□ 2.03
UPP1-209ENST00000444999 RGL3Q3MIN7 710 aa27.7■■■□□ 2.02
UPP1-209ENST00000444999 MST1RQ04912 1400 aa27.68■■■□□ 2.02
UPP1-209ENST00000444999 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.68■■■□□ 2.02
UPP1-209ENST00000444999 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.68■■■□□ 2.02
UPP1-209ENST00000444999 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
UPP1-209ENST00000444999 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.67■■■□□ 2.02
UPP1-209ENST00000444999 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.67■■■□□ 2.02
UPP1-209ENST00000444999 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.67■■■□□ 2.02
UPP1-209ENST00000444999 PTCH1Q13635 1447 aa27.65■■■□□ 2.02
UPP1-209ENST00000444999 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.63■■■□□ 2.01
UPP1-209ENST00000444999 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.62■■■□□ 2.01
UPP1-209ENST00000444999 POTEAQ6S8J7 498 aa27.61■■■□□ 2.01
UPP1-209ENST00000444999 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.6■■■□□ 2.01
UPP1-209ENST00000444999 IFT172Q9UG01 1749 aa27.59■■■□□ 2.01
UPP1-209ENST00000444999 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
UPP1-209ENST00000444999 LRP6O75581 1613 aa27.59■■■□□ 2.01
UPP1-209ENST00000444999 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
UPP1-209ENST00000444999 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.57■■■□□ 2
UPP1-209ENST00000444999 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.57■■■□□ 2
UPP1-209ENST00000444999 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.56■■■□□ 2
UPP1-209ENST00000444999 SHPRHQ149N8 1683 aa27.56■■■□□ 2
UPP1-209ENST00000444999 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.55■■■□□ 2
UPP1-209ENST00000444999 PIK3C2GO75747 1445 aa27.52■■■□□ 2
UPP1-209ENST00000444999 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.52■■■□□ 2
UPP1-209ENST00000444999 STK26Q9P289 416 aa27.52■■■□□ 2
UPP1-209ENST00000444999 ORAI2Q96SN7 254 aa27.5■■□□□ 1.99
UPP1-209ENST00000444999 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
UPP1-209ENST00000444999 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
UPP1-209ENST00000444999 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
UPP1-209ENST00000444999 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.48■■□□□ 1.99
UPP1-209ENST00000444999 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
UPP1-209ENST00000444999 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
UPP1-209ENST00000444999 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
UPP1-209ENST00000444999 TECPR2O15040 1411 aa27.46■■□□□ 1.99
UPP1-209ENST00000444999 ABCC11Q96J66 1382 aa27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms