RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439372.5

ATP6AP1-204, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, human

TSL 4

Gene ATP6AP1, Length 604 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.81	■■■■□ 3
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.81	■■■■□ 3
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.8	■■■■□ 3
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.8	■■■■□ 3
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.78	■■■■□ 3
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		33.78	■■■■□ 3
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.77	■■■■□ 3
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.77	■■■■□ 3
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PPL	O60437	1756 aa		33.73	■■■□□ 2.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.7	■■■□□ 2.99
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IFT172	Q9UG01	1749 aa		33.7	■■■□□ 2.98
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RGL3	Q3MIN7	710 aa		33.69	■■■□□ 2.98
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.67	■■■□□ 2.98
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.64	■■■□□ 2.98
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.61	■■■□□ 2.97
ATP6AP1-204	ENST00000439372	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.59	■■■□□ 2.97
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.59	■■■□□ 2.97
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.57	■■■□□ 2.96
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.56	■■■□□ 2.96
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.56	■■■□□ 2.96
ATP6AP1-204	ENST00000439372	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		33.55	■■■□□ 2.96
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.54	■■■□□ 2.96
ATP6AP1-204	ENST00000439372	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		33.52	■■■□□ 2.96
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.51	■■■□□ 2.96
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		33.49	■■■□□ 2.95
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NEUROD1	Q13562	356 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MYOM2	P54296	1465 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ALK	Q9UM73	1620 aa		33.44	■■■□□ 2.94
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		33.43	■■■□□ 2.94
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.42	■■■□□ 2.94
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NWD1	Q149M9	1564 aa		33.42	■■■□□ 2.94
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33.41	■■■□□ 2.94
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PIK3C2G	O75747	1445 aa		33.41	■■■□□ 2.94
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CPS1	P31327	1500 aa		33.38	■■■□□ 2.93
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MET	P08581	1390 aa		33.38	■■■□□ 2.93
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.36	■■■□□ 2.93
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KCNA6	P17658	529 aa		33.36	■■■□□ 2.93
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.34	■■■□□ 2.93
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ATP6AP1-204	ENST00000439372	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.33	■■■□□ 2.93
ATP6AP1-204	ENST00000439372	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LAMC1	P11047	1609 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ATP6AP1-204	ENST00000439372	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.3	■■■□□ 2.92
ATP6AP1-204	ENST00000439372	STAC3	Q96MF2	364 aa		33.29	■■■□□ 2.92
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		33.27	■■■□□ 2.92
ATP6AP1-204	ENST00000439372	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	33.26	■■■□□ 2.91
ATP6AP1-204	ENST00000439372	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.26	■■■□□ 2.91
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TONSL	Q96HA7	1378 aa		33.25	■■■□□ 2.91
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
ATP6AP1-204	ENST00000439372	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.2	■■■□□ 2.91
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	33.2	■■■□□ 2.91
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TMEM94	Q12767	1356 aa		33.18	■■■□□ 2.9
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ADGRB1	O14514	1584 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		33.17	■■■□□ 2.9
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		33.16	■■■□□ 2.9
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
ATP6AP1-204	ENST00000439372	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
ATP6AP1-204	ENST00000439372	STK26	Q9P289	416 aa		33.12	■■■□□ 2.89
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PTCH1	Q13635	1447 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		33.11	■■■□□ 2.89
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TECPR2	O15040	1411 aa		33.1	■■■□□ 2.89
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ABCC11	Q96J66	1382 aa		33.08	■■■□□ 2.89
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		33.03	■■■□□ 2.88
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DLC1	Q96QB1	1528 aa		33	■■■□□ 2.87
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ATP6AP1-204	ENST00000439372	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ATP6AP1-204	ENST00000439372	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MSH6	P52701	1360 aa		32.98	■■■□□ 2.87
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.98	■■■□□ 2.87
ATP6AP1-204	ENST00000439372	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.97	■■■□□ 2.87
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.96	■■■□□ 2.87
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.94	■■■□□ 2.86
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ATP6AP1-204	ENST00000439372	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.92	■■■□□ 2.86
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.91	■■■□□ 2.86
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TOM1	O60784	492 aa		32.9	■■■□□ 2.86

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