RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438576.2

C11orf68-201, Transcript of chromosome 11 open reading frame 68, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene C11orf68, Length 1,619 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf68-201ENST00000438576 ZFYVE9O95405 1425 aa42.46■■■■■ 4.39
C11orf68-201ENST00000438576 MED14O60244 1454 aa42.45■■■■■ 4.39
C11orf68-201ENST00000438576 RIMS2Q9UQ26 1411 aa42.44■■■■■ 4.39
C11orf68-201ENST00000438576 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
C11orf68-201ENST00000438576 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
C11orf68-201ENST00000438576 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
C11orf68-201ENST00000438576 CLSPNQ9HAW4 1339 aa42.37■■■■■ 4.37
C11orf68-201ENST00000438576 IQGAP1P46940 1657 aa42.36■■■■■ 4.37
C11orf68-201ENST00000438576 HDGFP51858 240 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
C11orf68-201ENST00000438576 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
C11orf68-201ENST00000438576 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
C11orf68-201ENST00000438576 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa42.33■■■■■ 4.37
C11orf68-201ENST00000438576 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
C11orf68-201ENST00000438576 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP42.32■■■■■ 4.37
C11orf68-201ENST00000438576 RGL3Q3MIN7 710 aa42.3■■■■■ 4.36
C11orf68-201ENST00000438576 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa42.29■■■■■ 4.36
C11orf68-201ENST00000438576 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa42.25■■■■■ 4.35
C11orf68-201ENST00000438576 BCANQ96GW7 911 aa42.23■■■■■ 4.35
C11orf68-201ENST00000438576 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa42.21■■■■■ 4.35
C11orf68-201ENST00000438576 SLC26A8Q96RN1 970 aa42.21■■■■■ 4.35
C11orf68-201ENST00000438576 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
C11orf68-201ENST00000438576 PPLO60437 1756 aa42.16■■■■■ 4.34
C11orf68-201ENST00000438576 VGFO15240 615 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
C11orf68-201ENST00000438576 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa42.1■■■■■ 4.33
C11orf68-201ENST00000438576 LTBP4Q8N2S1 1624 aa42.09■■■■■ 4.33
C11orf68-201ENST00000438576 SIN3AQ96ST3 1273 aa42.09■■■■■ 4.33
C11orf68-201ENST00000438576 IFT172Q9UG01 1749 aa42.08■■■■■ 4.33
C11orf68-201ENST00000438576 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa42.07■■■■■ 4.32
C11orf68-201ENST00000438576 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa42.05■■■■■ 4.32
C11orf68-201ENST00000438576 TBX22Q9Y458 520 aa42.05■■■■■ 4.32
C11orf68-201ENST00000438576 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa42.04■■■■■ 4.32
C11orf68-201ENST00000438576 STRCP1A6NGW2 1772 aa42■■■■■ 4.31
C11orf68-201ENST00000438576 NEUROD1Q13562 356 aa41.98■■■■■ 4.31
C11orf68-201ENST00000438576 DIP2AQ14689 1571 aa41.96■■■■■ 4.31
C11orf68-201ENST00000438576 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.95■■■■■ 4.31
C11orf68-201ENST00000438576 CERKQ8TCT0 537 aa41.93■■■■■ 4.3
C11orf68-201ENST00000438576 KCNA6P17658 529 aa41.92■■■■■ 4.3
C11orf68-201ENST00000438576 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.92■■■■■ 4.3
C11orf68-201ENST00000438576 MYOM2P54296 1465 aa41.91■■■■■ 4.3
C11orf68-201ENST00000438576 METP08581 1390 aa41.9■■■■■ 4.3
C11orf68-201ENST00000438576 ALKQ9UM73 1620 aa41.89■■■■■ 4.3
C11orf68-201ENST00000438576 CPS1P31327 1500 aa41.89■■■■■ 4.3
C11orf68-201ENST00000438576 PIK3C2GO75747 1445 aa41.88■■■■■ 4.3
C11orf68-201ENST00000438576 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.29
C11orf68-201ENST00000438576 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.87■■■■■ 4.29
C11orf68-201ENST00000438576 PIK3R4Q99570 1358 aa41.86■■■■■ 4.29
C11orf68-201ENST00000438576 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
C11orf68-201ENST00000438576 PTPRUQ92729 1446 aa41.85■■■■■ 4.29
C11orf68-201ENST00000438576 NWD1Q149M9 1564 aa41.83■■■■■ 4.29
C11orf68-201ENST00000438576 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.81■■■■■ 4.28
C11orf68-201ENST00000438576 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.81■■■■■ 4.28
C11orf68-201ENST00000438576 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.8■■■■■ 4.28
C11orf68-201ENST00000438576 STAC3Q96MF2 364 aa41.79■■■■■ 4.28
C11orf68-201ENST00000438576 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.77■■■■■ 4.28
C11orf68-201ENST00000438576 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
C11orf68-201ENST00000438576 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
C11orf68-201ENST00000438576 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
C11orf68-201ENST00000438576 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
C11orf68-201ENST00000438576 TMEM132EQ6IEE7 984 aa41.71■■■■■ 4.27
C11orf68-201ENST00000438576 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
C11orf68-201ENST00000438576 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa41.69■■■■■ 4.26
C11orf68-201ENST00000438576 TMEM94Q12767 1356 aa41.68■■■■■ 4.26
C11orf68-201ENST00000438576 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
C11orf68-201ENST00000438576 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.67■■■■■ 4.26
C11orf68-201ENST00000438576 LAMC1P11047 1609 aa41.63■■■■■ 4.26
C11orf68-201ENST00000438576 TONSLQ96HA7 1378 aa41.62■■■■■ 4.25
C11orf68-201ENST00000438576 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.62■■■■■ 4.25
C11orf68-201ENST00000438576 STK26Q9P289 416 aa41.6■■■■■ 4.25
C11orf68-201ENST00000438576 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.24
C11orf68-201ENST00000438576 ROBO2Q9HCK4 1378 aa41.57■■■■■ 4.24
C11orf68-201ENST00000438576 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
C11orf68-201ENST00000438576 ADGRB1O14514 1584 aa41.55■■■■■ 4.24
C11orf68-201ENST00000438576 PTCH1Q13635 1447 aa41.52■■■■■ 4.24
C11orf68-201ENST00000438576 ABCC11Q96J66 1382 aa41.51■■■■■ 4.24
C11orf68-201ENST00000438576 TECPR2O15040 1411 aa41.49■■■■■ 4.23
C11orf68-201ENST00000438576 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.48■■■■■ 4.23
C11orf68-201ENST00000438576 NBPF1Q3BBV0 1214 aa41.48■■■■■ 4.23
C11orf68-201ENST00000438576 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
C11orf68-201ENST00000438576 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.47■■■■■ 4.23
C11orf68-201ENST00000438576 FBXO41Q8TF61 875 aa41.47■■■■■ 4.23
C11orf68-201ENST00000438576 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.47■■■■■ 4.23
C11orf68-201ENST00000438576 C14orf37Q86TY3 774 aa41.47■■■■■ 4.23
C11orf68-201ENST00000438576 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa41.47■■■■■ 4.23
C11orf68-201ENST00000438576 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.44■■■■■ 4.22
C11orf68-201ENST00000438576 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.44■■■■■ 4.22
C11orf68-201ENST00000438576 WAPLQ7Z5K2 1190 aa41.44■■■■■ 4.22
C11orf68-201ENST00000438576 MSH6P52701 1360 aa41.42■■■■■ 4.22
C11orf68-201ENST00000438576 TRAK1Q9UPV9 953 aa41.4■■■■■ 4.22
C11orf68-201ENST00000438576 TOM1O60784 492 aa41.4■■■■■ 4.22
C11orf68-201ENST00000438576 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.4■■■■■ 4.22
C11orf68-201ENST00000438576 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.39■■■■■ 4.22
C11orf68-201ENST00000438576 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa41.37■■■■■ 4.21
C11orf68-201ENST00000438576 SIRT1Q96EB6 747 aa41.36■■■■■ 4.21
C11orf68-201ENST00000438576 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
C11orf68-201ENST00000438576 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.34■■■■■ 4.21
C11orf68-201ENST00000438576 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.34■■■■■ 4.21
C11orf68-201ENST00000438576 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.34■■■■■ 4.21
C11orf68-201ENST00000438576 PRAM1Q96QH2 718 aa41.33■■■■■ 4.21
C11orf68-201ENST00000438576 DLC1Q96QB1 1528 aa41.32■■■■■ 4.21
C11orf68-201ENST00000438576 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms