RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 HMOX1P09601 288 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 APPP05067 770 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 WWC1Q8IX03 1113 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 TPM3P06753 285 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 FBXW7Q969H0 707 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.08■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
PTPRF-209ENST00000438120 CEP89Q96ST8 783 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.07■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 BECN2A8MW95 431 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 VPS37DQ86XT2 251 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 CABP2Q9NPB3 220 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 FOSBP53539 338 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 OSCARQ8IYS5 282 aa21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.03■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
PTPRF-209ENST00000438120 RUNDC1Q96C34 613 aa21.02■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 REC8O95072 547 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 LNPKQ9C0E8 428 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 CPLX1O14810 134 aa21.01■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 TRIM29Q14134 588 aa21■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 AMOTL1Q8IY63 956 aa21■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 PANK1Q8TE04 598 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF592Q92610 1267 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 KLHL34Q8N239 644 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRF-209ENST00000438120 GSE1Q14687 1217 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 TRDNQ13061 729 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 BICD2Q8TD16 824 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 FYB1O15117 783 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 GNAI1P63096 354 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 ATF3P18847 181 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 TPM2P07951 284 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 KDM4AO75164 1064 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 USP35Q9P2H5 1018 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 NLRP6P59044 892 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 TPM1P09493 284 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 RNF20Q5VTR2 975 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 SMARCA4P51532 1647 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC7Q96M83 1385 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 FAM177BA6PVY3 158 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 WASHC4Q2M389 1173 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 ROCK1Q13464 1354 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 MTMR7Q9Y216 660 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 IGF1RP08069 1367 aa20.89■□□□□ 0.94
PTPRF-209ENST00000438120 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRF-209ENST00000438120 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRF-209ENST00000438120 ERICH2A1L162 156 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRF-209ENST00000438120 MTHFSP49914 203 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRF-209ENST00000438120 CCDC27Q2M243 656 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF428Q96B54 188 aa20.88■□□□□ 0.93
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