RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433137.1

MED28P4-201, Transcript of mediator complex subunit 28 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene MED28P4, Length 572 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28P4-201ENST00000433137 TOP2BQ02880 1626 aa10.98□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 SYNJ1O43426 1573 aa10.98□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 C14orf37Q86TY3 774 aa10.97□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa10.96□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 CUX2O14529 1486 aa10.96□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 EYA1Q99502 592 aa10.96□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 KCNK17Q96T54 332 aa10.95□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 SOGA1O94964 1423 aa10.94□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10.94□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 PROX2Q3B8N5 592 aa10.94□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 ERICH6Q7L0X2 663 aa10.94□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.93□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 NUDT18Q6ZVK8 323 aa10.93□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 RCCD1A6NED2 376 aa10.92□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.92□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 GOPCQ9HD26 462 aa10.92□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.92□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 ST18O60284 1047 aa10.91□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 PSEN2P49810 448 aa10.91□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.91□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 TATDN2Q93075 761 aa10.9□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 PNMA3Q9UL41 463 aa10.9□□□□□ -0.66
MED28P4-201ENST00000433137 ERBB3P21860 1342 aa10.89□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 NBPF26B4DH59 902 aa10.89□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.89□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 IFT140Q96RY7 1462 aa10.88□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 SMAPO00193 183 aa10.88□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.88□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 PACS2Q86VP3 889 aa10.88□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 MARVELD3Q96A59 401 aa10.87□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.87□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.86□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 DNAJB2P25686 324 aa10.85□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 DMRTA1Q5VZB9 504 aa10.85□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 KIAA1468Q9P260 1216 aa10.85□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 ARHGAP33O14559 1287 aa10.84□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 EMP3P54852 163 aa10.84□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 KCNH8Q96L42 1107 aa10.84□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 TMEM134Q9H6X4 195 aa10.84□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
MED28P4-201ENST00000433137 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.83□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.83□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 IGF1RP08069 1367 aa10.82□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 CD46P15529 392 aa10.82□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 MYSM1Q5VVJ2 828 aa10.82□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa10.82□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.81□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.81□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 POTEB3A0JP26 581 aa10.8□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 FAM205CA6NFA0 338 aa10.8□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 DDX11L8A8MPP1 907 aa10.8□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 POTEBQ6S5H4 581 aa10.8□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.8□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.8□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 WDR97A6NE52 1622 aa10.8□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 KIF27Q86VH2 1401 aa10.79□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.79□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.79□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 PBX2P40425 430 aa10.78□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 SULF1Q8IWU6 871 aa10.78□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
MED28P4-201ENST00000433137 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.77□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa10.77□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP10.76□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10.76□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 CLK2P49760 499 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.75□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 EEA1Q15075 1411 aa10.75□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 GRIN2BQ13224 1484 aa10.74□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.74□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.74□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.73□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 SLC10A3P09131 477 aa10.72□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 RDH13Q8NBN7 331 aa10.72□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa10.71□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.71□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.71□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 ZMYND15Q9H091 742 aa10.71□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
MED28P4-201ENST00000433137 MOXD2PA6NHM9 499 aa10.7□□□□□ -0.7
MED28P4-201ENST00000433137 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms