RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 JCADQ9P266 1359 aa30.33■■■□□ 2.45
LTB-210ENST00000429299 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
LTB-210ENST00000429299 NWD1Q149M9 1564 aa30.32■■■□□ 2.45
LTB-210ENST00000429299 ADGRB3O60242 1522 aa30.32■■■□□ 2.44
LTB-210ENST00000429299 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.3■■■□□ 2.44
LTB-210ENST00000429299 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.27■■■□□ 2.44
LTB-210ENST00000429299 TBX22Q9Y458 520 aa30.25■■■□□ 2.43
LTB-210ENST00000429299 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
LTB-210ENST00000429299 PHLPP1O60346 1717 aa30.25■■■□□ 2.43
LTB-210ENST00000429299 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
LTB-210ENST00000429299 ZFYVE9O95405 1425 aa30.23■■■□□ 2.43
LTB-210ENST00000429299 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.23■■■□□ 2.43
LTB-210ENST00000429299 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
LTB-210ENST00000429299 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.2■■■□□ 2.42
LTB-210ENST00000429299 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.2■■■□□ 2.42
LTB-210ENST00000429299 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.19■■■□□ 2.42
LTB-210ENST00000429299 ADGRL2O95490 1459 aa30.18■■■□□ 2.42
LTB-210ENST00000429299 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
LTB-210ENST00000429299 C14orf37Q86TY3 774 aa30.17■■■□□ 2.42
LTB-210ENST00000429299 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.16■■■□□ 2.42
LTB-210ENST00000429299 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.16■■■□□ 2.42
LTB-210ENST00000429299 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.15■■■□□ 2.42
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LTB-210ENST00000429299 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.41
LTB-210ENST00000429299 ATF3P18847 181 aa30.12■■■□□ 2.41
LTB-210ENST00000429299 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
LTB-210ENST00000429299 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.11■■■□□ 2.41
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LTB-210ENST00000429299 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.09■■■□□ 2.41
LTB-210ENST00000429299 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.09■■■□□ 2.41
LTB-210ENST00000429299 LRP6O75581 1613 aa30.08■■■□□ 2.41
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LTB-210ENST00000429299 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.06■■■□□ 2.4
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LTB-210ENST00000429299 TRIM52Q96A61 297 aa30.04■■■□□ 2.4
LTB-210ENST00000429299 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
LTB-210ENST00000429299 RXRBP28702 533 aa30.03■■■□□ 2.4
LTB-210ENST00000429299 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
LTB-210ENST00000429299 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.01■■■□□ 2.39
LTB-210ENST00000429299 DIP2AQ14689 1571 aa30.01■■■□□ 2.39
LTB-210ENST00000429299 BRINP3Q76B58 766 aa30■■■□□ 2.39
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LTB-210ENST00000429299 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
LTB-210ENST00000429299 TRPM2O94759 1503 aa29.92■■■□□ 2.38
LTB-210ENST00000429299 UNC13BO14795 1591 aa29.92■■■□□ 2.38
LTB-210ENST00000429299 DCCP43146 1447 aa29.92■■■□□ 2.38
LTB-210ENST00000429299 PTPRUQ92729 1446 aa29.91■■■□□ 2.38
LTB-210ENST00000429299 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
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LTB-210ENST00000429299 NUP155O75694 1391 aa29.84■■■□□ 2.37
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LTB-210ENST00000429299 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
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LTB-210ENST00000429299 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.74■■■□□ 2.35
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LTB-210ENST00000429299 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.73■■■□□ 2.35
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LTB-210ENST00000429299 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
LTB-210ENST00000429299 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.71■■■□□ 2.35
LTB-210ENST00000429299 NGLY1Q96IV0 654 aa29.69■■■□□ 2.34
LTB-210ENST00000429299 RGS12O14924 1447 aa29.69■■■□□ 2.34
LTB-210ENST00000429299 ADAMTS2O95450 1211 aa29.64■■■□□ 2.34
LTB-210ENST00000429299 ITGAEP38570 1179 aa29.63■■■□□ 2.33
LTB-210ENST00000429299 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.61■■■□□ 2.33
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LTB-210ENST00000429299 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
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LTB-210ENST00000429299 FOXD1Q16676 465 aa29.55■■■□□ 2.32
LTB-210ENST00000429299 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.55■■■□□ 2.32
LTB-210ENST00000429299 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
LTB-210ENST00000429299 LAMC1P11047 1609 aa29.53■■■□□ 2.32
LTB-210ENST00000429299 PTCH1Q13635 1447 aa29.52■■■□□ 2.32
LTB-210ENST00000429299 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.5■■■□□ 2.31
LTB-210ENST00000429299 CLTCL1P53675 1640 aa29.47■■■□□ 2.31
LTB-210ENST00000429299 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.46■■■□□ 2.31
LTB-210ENST00000429299 CCDC125Q86Z20 511 aa29.45■■■□□ 2.31
LTB-210ENST00000429299 ATRNO75882 1429 aa29.44■■■□□ 2.3
LTB-210ENST00000429299 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.44■■■□□ 2.3
LTB-210ENST00000429299 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.44■■■□□ 2.3
LTB-210ENST00000429299 KIF1BO60333 1816 aa29.43■■■□□ 2.3
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