RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 SLIT1O75093 1534 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXA4-202ENST00000428284 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXA4-202ENST00000428284 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXA4-202ENST00000428284 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXA4-202ENST00000428284 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXA4-202ENST00000428284 ZFYVE9O95405 1425 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXA4-202ENST00000428284 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXA4-202ENST00000428284 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
HOXA4-202ENST00000428284 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
HOXA4-202ENST00000428284 MYOM2P54296 1465 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
HOXA4-202ENST00000428284 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
HOXA4-202ENST00000428284 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.6■■■□□ 2.33
HOXA4-202ENST00000428284 EID1Q9Y6B2 187 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXA4-202ENST00000428284 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXA4-202ENST00000428284 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXA4-202ENST00000428284 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXA4-202ENST00000428284 STAC3Q96MF2 364 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXA4-202ENST00000428284 LTKP29376 864 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXA4-202ENST00000428284 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
HOXA4-202ENST00000428284 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXA4-202ENST00000428284 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXA4-202ENST00000428284 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXA4-202ENST00000428284 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXA4-202ENST00000428284 IQGAP1P46940 1657 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXA4-202ENST00000428284 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
HOXA4-202ENST00000428284 PIK3C2GO75747 1445 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXA4-202ENST00000428284 STRCQ7RTU9 1775 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXA4-202ENST00000428284 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.49■■■□□ 2.31
HOXA4-202ENST00000428284 BCANQ96GW7 911 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXA4-202ENST00000428284 LAMC1P11047 1609 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXA4-202ENST00000428284 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXA4-202ENST00000428284 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.48■■■□□ 2.31
HOXA4-202ENST00000428284 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXA4-202ENST00000428284 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXA4-202ENST00000428284 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.47■■■□□ 2.31
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.46■■■□□ 2.31
HOXA4-202ENST00000428284 MED14O60244 1454 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXA4-202ENST00000428284 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
HOXA4-202ENST00000428284 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
HOXA4-202ENST00000428284 ALKQ9UM73 1620 aa29.42■■■□□ 2.3
HOXA4-202ENST00000428284 DIP2AQ14689 1571 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXA4-202ENST00000428284 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.39■■■□□ 2.29
HOXA4-202ENST00000428284 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXA4-202ENST00000428284 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXA4-202ENST00000428284 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
HOXA4-202ENST00000428284 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXA4-202ENST00000428284 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
HOXA4-202ENST00000428284 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXA4-202ENST00000428284 ADGRB1O14514 1584 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXA4-202ENST00000428284 TBX22Q9Y458 520 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.28■■■□□ 2.28
HOXA4-202ENST00000428284 METP08581 1390 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXA4-202ENST00000428284 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXA4-202ENST00000428284 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
HOXA4-202ENST00000428284 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.25■■■□□ 2.27
HOXA4-202ENST00000428284 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
HOXA4-202ENST00000428284 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXA4-202ENST00000428284 PIK3R4Q99570 1358 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXA4-202ENST00000428284 STK26Q9P289 416 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXA4-202ENST00000428284 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
HOXA4-202ENST00000428284 PTPRUQ92729 1446 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXA4-202ENST00000428284 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
HOXA4-202ENST00000428284 NWD1Q149M9 1564 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXA4-202ENST00000428284 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXA4-202ENST00000428284 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXA4-202ENST00000428284 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXA4-202ENST00000428284 USP47Q96K76 1375 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXA4-202ENST00000428284 CPS1P31327 1500 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXA4-202ENST00000428284 ABCC11Q96J66 1382 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXA4-202ENST00000428284 DLC1Q96QB1 1528 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXA4-202ENST00000428284 TECPR2O15040 1411 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXA4-202ENST00000428284 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXA4-202ENST00000428284 KCNA6P17658 529 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXA4-202ENST00000428284 PTCH1Q13635 1447 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
HOXA4-202ENST00000428284 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXA4-202ENST00000428284 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
HOXA4-202ENST00000428284 CERKQ8TCT0 537 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXA4-202ENST00000428284 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXA4-202ENST00000428284 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXA4-202ENST00000428284 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXA4-202ENST00000428284 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXA4-202ENST00000428284 PRAM1Q96QH2 718 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXA4-202ENST00000428284 POGKQ9P215 609 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXA4-202ENST00000428284 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
HOXA4-202ENST00000428284 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
HOXA4-202ENST00000428284 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29■■■□□ 2.23
HOXA4-202ENST00000428284 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
HOXA4-202ENST00000428284 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29■■■□□ 2.23
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXA4-202ENST00000428284 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
HOXA4-202ENST00000428284 SIRT1Q96EB6 747 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXA4-202ENST00000428284 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXA4-202ENST00000428284 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
HOXA4-202ENST00000428284 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
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