RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXD12-201ENST00000404162 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
HOXD12-201ENST00000404162 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 LRP6O75581 1613 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.34■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 ZFYVE9O95405 1425 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM52Q96A61 297 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 TBX22Q9Y458 520 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 C14orf37Q86TY3 774 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 SHPRHQ149N8 1683 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRL2O95490 1459 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 ATF3P18847 181 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 RXRBP28702 533 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 APLP2Q06481 763 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXD12-201ENST00000404162 DIP2AQ14689 1571 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXD12-201ENST00000404162 BRINP3Q76B58 766 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3R4Q99570 1358 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXD12-201ENST00000404162 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRUQ92729 1446 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXD12-201ENST00000404162 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
HOXD12-201ENST00000404162 AFF2P51816 1311 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXD12-201ENST00000404162 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
HOXD12-201ENST00000404162 E9PCH4 1651 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXD12-201ENST00000404162 TRPM2O94759 1503 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXD12-201ENST00000404162 UNC13BO14795 1591 aa30■■■□□ 2.39
HOXD12-201ENST00000404162 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30■■■□□ 2.39
HOXD12-201ENST00000404162 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXD12-201ENST00000404162 DCCP43146 1447 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXD12-201ENST00000404162 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXD12-201ENST00000404162 MST1RQ04912 1400 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXD12-201ENST00000404162 RGS12O14924 1447 aa29.95■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 C8orf37Q96NL8 207 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.89■■■□□ 2.37
HOXD12-201ENST00000404162 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.89■■■□□ 2.37
HOXD12-201ENST00000404162 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD12-201ENST00000404162 METP08581 1390 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD12-201ENST00000404162 NUP155O75694 1391 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTS2O95450 1211 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD12-201ENST00000404162 NGLY1Q96IV0 654 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD12-201ENST00000404162 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
HOXD12-201ENST00000404162 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD12-201ENST00000404162 ROCK1Q13464 1354 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXD12-201ENST00000404162 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.72■■■□□ 2.35
HOXD12-201ENST00000404162 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXD12-201ENST00000404162 USP21Q9UK80 565 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXD12-201ENST00000404162 ORAI2Q96SN7 254 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 LAMC1P11047 1609 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 ITGAEP38570 1179 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXD12-201ENST00000404162 PTCH1Q13635 1447 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXD12-201ENST00000404162 ATRNO75882 1429 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXD12-201ENST00000404162 CLTCL1P53675 1640 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXD12-201ENST00000404162 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD12-201ENST00000404162 FOXD1Q16676 465 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD12-201ENST00000404162 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
HOXD12-201ENST00000404162 EP400Q96L91 3159 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD12-201ENST00000404162 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 KIF1BO60333 1816 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 MYOM2P54296 1465 aa29.5■■■□□ 2.31
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