RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXD12-201ENST00000404162 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
HOXD12-201ENST00000404162 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 LRP6O75581 1613 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.34■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 ZFYVE9O95405 1425 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM52Q96A61 297 aa30.3■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
HOXD12-201ENST00000404162 TBX22Q9Y458 520 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30.26■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 C14orf37Q86TY3 774 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 SHPRHQ149N8 1683 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXD12-201ENST00000404162 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRL2O95490 1459 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 ATF3P18847 181 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 RXRBP28702 533 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 APLP2Q06481 763 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXD12-201ENST00000404162 DIP2AQ14689 1571 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXD12-201ENST00000404162 BRINP3Q76B58 766 aa30.12■■■□□ 2.41
HOXD12-201ENST00000404162 PIK3R4Q99570 1358 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXD12-201ENST00000404162 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.08■■■□□ 2.41
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRUQ92729 1446 aa30.07■■■□□ 2.4
HOXD12-201ENST00000404162 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
HOXD12-201ENST00000404162 AFF2P51816 1311 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXD12-201ENST00000404162 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
HOXD12-201ENST00000404162 E9PCH4 1651 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXD12-201ENST00000404162 TRPM2O94759 1503 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXD12-201ENST00000404162 UNC13BO14795 1591 aa30■■■□□ 2.39
HOXD12-201ENST00000404162 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30■■■□□ 2.39
HOXD12-201ENST00000404162 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.99■■■□□ 2.39
HOXD12-201ENST00000404162 DCCP43146 1447 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXD12-201ENST00000404162 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXD12-201ENST00000404162 MST1RQ04912 1400 aa29.96■■■□□ 2.39
HOXD12-201ENST00000404162 RGS12O14924 1447 aa29.95■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 C8orf37Q96NL8 207 aa29.93■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXD12-201ENST00000404162 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.89■■■□□ 2.37
HOXD12-201ENST00000404162 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.89■■■□□ 2.37
HOXD12-201ENST00000404162 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXD12-201ENST00000404162 METP08581 1390 aa29.84■■■□□ 2.37
HOXD12-201ENST00000404162 NUP155O75694 1391 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTS2O95450 1211 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD12-201ENST00000404162 NGLY1Q96IV0 654 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXD12-201ENST00000404162 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.77■■■□□ 2.36
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
HOXD12-201ENST00000404162 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD12-201ENST00000404162 ROCK1Q13464 1354 aa29.76■■■□□ 2.35
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXD12-201ENST00000404162 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.72■■■□□ 2.35
HOXD12-201ENST00000404162 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXD12-201ENST00000404162 USP21Q9UK80 565 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXD12-201ENST00000404162 ORAI2Q96SN7 254 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 LAMC1P11047 1609 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 ITGAEP38570 1179 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXD12-201ENST00000404162 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXD12-201ENST00000404162 PTCH1Q13635 1447 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXD12-201ENST00000404162 ATRNO75882 1429 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXD12-201ENST00000404162 CLTCL1P53675 1640 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXD12-201ENST00000404162 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD12-201ENST00000404162 FOXD1Q16676 465 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD12-201ENST00000404162 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
HOXD12-201ENST00000404162 EP400Q96L91 3159 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXD12-201ENST00000404162 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 KIF1BO60333 1816 aa29.51■■■□□ 2.31
HOXD12-201ENST00000404162 MYOM2P54296 1465 aa29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms