RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403904.5

CSNK1E-204, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-204ENST00000403904 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa48.09■■■■■ 5.29
CSNK1E-204ENST00000403904 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP48.09■■■■■ 5.29
CSNK1E-204ENST00000403904 ARHGAP23Q9P227 1491 aa48.08■■■■■ 5.29
CSNK1E-204ENST00000403904 PPLO60437 1756 aa48.07■■■■■ 5.29
CSNK1E-204ENST00000403904 ZFYVE9O95405 1425 aa48.07■■■■■ 5.28
CSNK1E-204ENST00000403904 DCAF11Q8TEB1 546 aa48.06■■■■■ 5.28
CSNK1E-204ENST00000403904 IFT172Q9UG01 1749 aa48.05■■■■■ 5.28
CSNK1E-204ENST00000403904 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa48.01■■■■■ 5.28
CSNK1E-204ENST00000403904 LTKP29376 864 aa48■■■■■ 5.28
CSNK1E-204ENST00000403904 TXNDC2Q86VQ3 553 aa48■■■■■ 5.28
CSNK1E-204ENST00000403904 HDGFP51858 240 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
CSNK1E-204ENST00000403904 EID1Q9Y6B2 187 aa47.99■■■■■ 5.27
CSNK1E-204ENST00000403904 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP47.97■■■■■ 5.27
CSNK1E-204ENST00000403904 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP47.96■■■■■ 5.27
CSNK1E-204ENST00000403904 ANKLE2Q86XL3 938 aa47.96■■■■■ 5.27
CSNK1E-204ENST00000403904 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa47.95■■■■■ 5.27
CSNK1E-204ENST00000403904 VGFO15240 615 aaPredicted RBP47.93■■■■■ 5.26
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CSNK1E-204ENST00000403904 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa47.91■■■■■ 5.26
CSNK1E-204ENST00000403904 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP47.9■■■■■ 5.26
CSNK1E-204ENST00000403904 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa47.9■■■■■ 5.26
CSNK1E-204ENST00000403904 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP47.89■■■■■ 5.26
CSNK1E-204ENST00000403904 MYOM2P54296 1465 aa47.88■■■■■ 5.26
CSNK1E-204ENST00000403904 STAC3Q96MF2 364 aa47.86■■■■■ 5.25
CSNK1E-204ENST00000403904 STRCQ7RTU9 1775 aa47.81■■■■■ 5.24
CSNK1E-204ENST00000403904 NRXN1Q9ULB1 1477 aa47.79■■■■■ 5.24
CSNK1E-204ENST00000403904 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa47.79■■■■■ 5.24
CSNK1E-204ENST00000403904 BCANQ96GW7 911 aa47.77■■■■■ 5.24
CSNK1E-204ENST00000403904 PIK3C2GO75747 1445 aa47.75■■■■■ 5.23
CSNK1E-204ENST00000403904 PRAG1Q86YV5 1406 aa47.74■■■■■ 5.23
CSNK1E-204ENST00000403904 MED14O60244 1454 aa47.74■■■■■ 5.23
CSNK1E-204ENST00000403904 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP47.72■■■■■ 5.23
CSNK1E-204ENST00000403904 IQGAP1P46940 1657 aa47.71■■■■■ 5.23
CSNK1E-204ENST00000403904 NBPF8Q3BBV2 869 aa47.7■■■■■ 5.23
CSNK1E-204ENST00000403904 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa47.69■■■■■ 5.23
CSNK1E-204ENST00000403904 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa47.69■■■■■ 5.22
CSNK1E-204ENST00000403904 SLC26A8Q96RN1 970 aa47.65■■■■■ 5.22
CSNK1E-204ENST00000403904 CFAP70Q5T0N1 1121 aa47.62■■■■■ 5.21
CSNK1E-204ENST00000403904 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa47.62■■■■■ 5.21
CSNK1E-204ENST00000403904 ALKQ9UM73 1620 aa47.61■■■■■ 5.21
CSNK1E-204ENST00000403904 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP47.59■■■■■ 5.21
CSNK1E-204ENST00000403904 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP47.55■■■■■ 5.2
CSNK1E-204ENST00000403904 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
CSNK1E-204ENST00000403904 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa47.54■■■■■ 5.2
CSNK1E-204ENST00000403904 LAMC1P11047 1609 aa47.54■■■■■ 5.2
CSNK1E-204ENST00000403904 TBX22Q9Y458 520 aa47.53■■■■■ 5.2
CSNK1E-204ENST00000403904 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa47.52■■■■■ 5.2
CSNK1E-204ENST00000403904 DIP2AQ14689 1571 aa47.5■■■■■ 5.2
CSNK1E-204ENST00000403904 NBPF1Q3BBV0 1214 aa47.49■■■■■ 5.19
CSNK1E-204ENST00000403904 DMRT2Q9Y5R5 561 aa47.49■■■■■ 5.19
CSNK1E-204ENST00000403904 METP08581 1390 aa47.47■■■■■ 5.19
CSNK1E-204ENST00000403904 TMEM132EQ6IEE7 984 aa47.47■■■■■ 5.19
CSNK1E-204ENST00000403904 RALGAPBQ86X10 1494 aa47.44■■■■■ 5.18
CSNK1E-204ENST00000403904 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa47.43■■■■■ 5.18
CSNK1E-204ENST00000403904 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
CSNK1E-204ENST00000403904 ADGRB1O14514 1584 aa47.4■■■■■ 5.18
CSNK1E-204ENST00000403904 PIK3R4Q99570 1358 aa47.32■■■■■ 5.17
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CSNK1E-204ENST00000403904 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP47.31■■■■■ 5.16
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CSNK1E-204ENST00000403904 CARD11Q9BXL7 1154 aa47.29■■■■■ 5.16
CSNK1E-204ENST00000403904 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
CSNK1E-204ENST00000403904 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa47.26■■■■■ 5.16
CSNK1E-204ENST00000403904 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.15
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CSNK1E-204ENST00000403904 TRAK1Q9UPV9 953 aa47.22■■■■■ 5.15
CSNK1E-204ENST00000403904 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP47.2■■■■■ 5.15
CSNK1E-204ENST00000403904 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.15
CSNK1E-204ENST00000403904 STRCP1A6NGW2 1772 aa47.19■■■■■ 5.14
CSNK1E-204ENST00000403904 ABCC11Q96J66 1382 aa47.18■■■■■ 5.14
CSNK1E-204ENST00000403904 NWD1Q149M9 1564 aa47.16■■■■■ 5.14
CSNK1E-204ENST00000403904 KNDC1Q76NI1 1749 aa47.14■■■■■ 5.14
CSNK1E-204ENST00000403904 TECPR2O15040 1411 aa47.12■■■■■ 5.13
CSNK1E-204ENST00000403904 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP47.09■■■■■ 5.13
CSNK1E-204ENST00000403904 ROBO2Q9HCK4 1378 aa47.09■■■■■ 5.13
CSNK1E-204ENST00000403904 CPS1P31327 1500 aa47.08■■■■■ 5.13
CSNK1E-204ENST00000403904 DLC1Q96QB1 1528 aa47.06■■■■■ 5.12
CSNK1E-204ENST00000403904 PTCH1Q13635 1447 aa47.05■■■■■ 5.12
CSNK1E-204ENST00000403904 USP47Q96K76 1375 aa47.04■■■■■ 5.12
CSNK1E-204ENST00000403904 WAPLQ7Z5K2 1190 aa47.03■■■■■ 5.12
CSNK1E-204ENST00000403904 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP47.03■■■■■ 5.12
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CSNK1E-204ENST00000403904 SIRT1Q96EB6 747 aa47■■■■■ 5.11
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CSNK1E-204ENST00000403904 FAM135BQ49AJ0 1406 aa46.99■■■■■ 5.11
CSNK1E-204ENST00000403904 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP46.98■■■■■ 5.11
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CSNK1E-204ENST00000403904 POGKQ9P215 609 aa46.98■■■■■ 5.11
CSNK1E-204ENST00000403904 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP46.98■■■■■ 5.11
CSNK1E-204ENST00000403904 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP46.95■■■■■ 5.11
CSNK1E-204ENST00000403904 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP46.93■■■■■ 5.1
CSNK1E-204ENST00000403904 LTBP4Q8N2S1 1624 aa46.93■■■■■ 5.1
CSNK1E-204ENST00000403904 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa46.93■■■■■ 5.1
CSNK1E-204ENST00000403904 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP46.9■■■■■ 5.1
CSNK1E-204ENST00000403904 LRRC7Q96NW7 1537 aa46.89■■■■■ 5.1
CSNK1E-204ENST00000403904 TMEM94Q12767 1356 aa46.87■■■■■ 5.09
CSNK1E-204ENST00000403904 QRICH2Q9H0J4 1663 aa46.87■■■■■ 5.09
CSNK1E-204ENST00000403904 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP46.86■■■■■ 5.09
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