RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
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HERC3-202ENST00000402738 TERF2IPQ9NYB0 399 aa11.82□□□□□ -0.52
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HERC3-202ENST00000402738 RIPK4P57078 832 aa11.8□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.8□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 SMC2O95347 1197 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 SDF4Q9BRK5 362 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.79□□□□□ -0.52
HERC3-202ENST00000402738 UACAQ9BZF9 1416 aa11.79□□□□□ -0.52
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