RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 DMRT2Q9Y5R5 561 aa44.13■■■■■ 4.65
PKDCC-202ENST00000401498 MED14O60244 1454 aa44.12■■■■■ 4.65
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
PKDCC-202ENST00000401498 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa44.08■■■■■ 4.65
PKDCC-202ENST00000401498 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP44.06■■■■■ 4.64
PKDCC-202ENST00000401498 HDGFP51858 240 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
PKDCC-202ENST00000401498 IQGAP1P46940 1657 aa44.03■■■■■ 4.64
PKDCC-202ENST00000401498 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP44.03■■■■■ 4.64
PKDCC-202ENST00000401498 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa44.02■■■■■ 4.64
PKDCC-202ENST00000401498 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP44.01■■■■■ 4.64
PKDCC-202ENST00000401498 RGL3Q3MIN7 710 aa43.99■■■■■ 4.63
PKDCC-202ENST00000401498 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
PKDCC-202ENST00000401498 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa43.95■■■■■ 4.63
PKDCC-202ENST00000401498 PPLO60437 1756 aa43.94■■■■■ 4.62
PKDCC-202ENST00000401498 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa43.92■■■■■ 4.62
PKDCC-202ENST00000401498 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP43.89■■■■■ 4.62
PKDCC-202ENST00000401498 IFT172Q9UG01 1749 aa43.88■■■■■ 4.62
PKDCC-202ENST00000401498 SIN3AQ96ST3 1273 aa43.85■■■■■ 4.61
PKDCC-202ENST00000401498 BCANQ96GW7 911 aa43.84■■■■■ 4.61
PKDCC-202ENST00000401498 VGFO15240 615 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
PKDCC-202ENST00000401498 SLC26A8Q96RN1 970 aa43.82■■■■■ 4.61
PKDCC-202ENST00000401498 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa43.78■■■■■ 4.6
PKDCC-202ENST00000401498 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa43.77■■■■■ 4.6
PKDCC-202ENST00000401498 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa43.76■■■■■ 4.6
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
PKDCC-202ENST00000401498 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa43.74■■■■■ 4.59
PKDCC-202ENST00000401498 NEUROD1Q13562 356 aa43.73■■■■■ 4.59
PKDCC-202ENST00000401498 TBX22Q9Y458 520 aa43.71■■■■■ 4.59
PKDCC-202ENST00000401498 DIP2AQ14689 1571 aa43.68■■■■■ 4.58
PKDCC-202ENST00000401498 DCAF11Q8TEB1 546 aa43.67■■■■■ 4.58
PKDCC-202ENST00000401498 MYOM2P54296 1465 aa43.67■■■■■ 4.58
PKDCC-202ENST00000401498 LTBP4Q8N2S1 1624 aa43.66■■■■■ 4.58
PKDCC-202ENST00000401498 STRCP1A6NGW2 1772 aa43.64■■■■■ 4.58
PKDCC-202ENST00000401498 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa43.63■■■■■ 4.57
PKDCC-202ENST00000401498 NRXN1Q9ULB1 1477 aa43.62■■■■■ 4.57
PKDCC-202ENST00000401498 PIK3C2GO75747 1445 aa43.6■■■■■ 4.57
PKDCC-202ENST00000401498 ALKQ9UM73 1620 aa43.6■■■■■ 4.57
PKDCC-202ENST00000401498 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
PKDCC-202ENST00000401498 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
PKDCC-202ENST00000401498 STAC3Q96MF2 364 aa43.57■■■■■ 4.57
PKDCC-202ENST00000401498 L3MBTL2Q969R5 705 aa43.56■■■■■ 4.56
PKDCC-202ENST00000401498 METP08581 1390 aa43.55■■■■■ 4.56
PKDCC-202ENST00000401498 CLSPNQ9HAW4 1339 aa43.54■■■■■ 4.56
PKDCC-202ENST00000401498 PIK3R4Q99570 1358 aa43.54■■■■■ 4.56
PKDCC-202ENST00000401498 KCNA6P17658 529 aa43.54■■■■■ 4.56
PKDCC-202ENST00000401498 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
PKDCC-202ENST00000401498 NWD1Q149M9 1564 aa43.51■■■■■ 4.56
PKDCC-202ENST00000401498 CPS1P31327 1500 aa43.5■■■■■ 4.55
PKDCC-202ENST00000401498 PTPRUQ92729 1446 aa43.49■■■■■ 4.55
PKDCC-202ENST00000401498 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
PKDCC-202ENST00000401498 CFAP70Q5T0N1 1121 aa43.44■■■■■ 4.54
PKDCC-202ENST00000401498 CERKQ8TCT0 537 aa43.42■■■■■ 4.54
PKDCC-202ENST00000401498 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa43.41■■■■■ 4.54
PKDCC-202ENST00000401498 LAMC1P11047 1609 aa43.41■■■■■ 4.54
PKDCC-202ENST00000401498 TONSLQ96HA7 1378 aa43.41■■■■■ 4.54
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC7Q96NW7 1537 aa43.4■■■■■ 4.54
PKDCC-202ENST00000401498 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
PKDCC-202ENST00000401498 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
PKDCC-202ENST00000401498 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa43.38■■■■■ 4.54
PKDCC-202ENST00000401498 PRAG1Q86YV5 1406 aa43.37■■■■■ 4.53
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM132EQ6IEE7 984 aa43.36■■■■■ 4.53
PKDCC-202ENST00000401498 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.52
PKDCC-202ENST00000401498 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP43.31■■■■■ 4.52
PKDCC-202ENST00000401498 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
PKDCC-202ENST00000401498 ADGRB1O14514 1584 aa43.27■■■■■ 4.52
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa43.27■■■■■ 4.52
PKDCC-202ENST00000401498 IQSEC2Q5JU85 1478 aa43.27■■■■■ 4.52
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM94Q12767 1356 aa43.26■■■■■ 4.52
PKDCC-202ENST00000401498 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
PKDCC-202ENST00000401498 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
PKDCC-202ENST00000401498 STK26Q9P289 416 aa43.23■■■■■ 4.51
PKDCC-202ENST00000401498 NBPF8Q3BBV2 869 aa43.2■■■■■ 4.51
PKDCC-202ENST00000401498 ABCC11Q96J66 1382 aa43.19■■■■■ 4.5
PKDCC-202ENST00000401498 ROBO2Q9HCK4 1378 aa43.19■■■■■ 4.5
PKDCC-202ENST00000401498 PTCH1Q13635 1447 aa43.19■■■■■ 4.5
PKDCC-202ENST00000401498 TECPR2O15040 1411 aa43.18■■■■■ 4.5
PKDCC-202ENST00000401498 KNDC1Q76NI1 1749 aa43.18■■■■■ 4.5
PKDCC-202ENST00000401498 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa43.18■■■■■ 4.5
PKDCC-202ENST00000401498 NBPF1Q3BBV0 1214 aa43.17■■■■■ 4.5
PKDCC-202ENST00000401498 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa43.17■■■■■ 4.5
PKDCC-202ENST00000401498 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa43.13■■■■■ 4.49
PKDCC-202ENST00000401498 TRAK1Q9UPV9 953 aa43.06■■■■■ 4.48
PKDCC-202ENST00000401498 WAPLQ7Z5K2 1190 aa43.05■■■■■ 4.48
PKDCC-202ENST00000401498 SIRT1Q96EB6 747 aa43.05■■■■■ 4.48
PKDCC-202ENST00000401498 DLC1Q96QB1 1528 aa43.04■■■■■ 4.48
PKDCC-202ENST00000401498 C14orf37Q86TY3 774 aa43.03■■■■■ 4.48
PKDCC-202ENST00000401498 FAM135BQ49AJ0 1406 aa43.02■■■■■ 4.48
PKDCC-202ENST00000401498 MSH6P52701 1360 aa43.02■■■■■ 4.48
PKDCC-202ENST00000401498 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa43.02■■■■■ 4.48
PKDCC-202ENST00000401498 NALCNQ8IZF0 1738 aa43■■■■■ 4.47
PKDCC-202ENST00000401498 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
PKDCC-202ENST00000401498 C19orf44Q9H6X5 657 aa42.99■■■■■ 4.47
PKDCC-202ENST00000401498 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
PKDCC-202ENST00000401498 UBAP1LF5GYI3 381 aa42.98■■■■■ 4.47
PKDCC-202ENST00000401498 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa42.97■■■■■ 4.47
PKDCC-202ENST00000401498 RALGAPBQ86X10 1494 aa42.97■■■■■ 4.47
PKDCC-202ENST00000401498 PRAM1Q96QH2 718 aa42.97■■■■■ 4.47
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
PKDCC-202ENST00000401498 GPRASP1Q5JY77 1395 aa42.94■■■■■ 4.46
PKDCC-202ENST00000401498 TOM1O60784 492 aa42.93■■■■■ 4.46
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