RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399892.6

SEH1L-202, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEH1L, Length 1,846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-202ENST00000399892 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SEH1L-202ENST00000399892 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.77■■□□□ 1.72
SEH1L-202ENST00000399892 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.77■■□□□ 1.72
SEH1L-202ENST00000399892 LTKP29376 864 aa25.75■■□□□ 1.71
SEH1L-202ENST00000399892 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SEH1L-202ENST00000399892 ZFYVE9O95405 1425 aa25.74■■□□□ 1.71
SEH1L-202ENST00000399892 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.74■■□□□ 1.71
SEH1L-202ENST00000399892 BCANQ96GW7 911 aa25.73■■□□□ 1.71
SEH1L-202ENST00000399892 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.72■■□□□ 1.71
SEH1L-202ENST00000399892 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.72■■□□□ 1.71
SEH1L-202ENST00000399892 NEUROD1Q13562 356 aa25.72■■□□□ 1.71
SEH1L-202ENST00000399892 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
SEH1L-202ENST00000399892 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
SEH1L-202ENST00000399892 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.7■■□□□ 1.71
SEH1L-202ENST00000399892 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.69■■□□□ 1.7
SEH1L-202ENST00000399892 IQGAP1P46940 1657 aa25.69■■□□□ 1.7
SEH1L-202ENST00000399892 PPLO60437 1756 aa25.69■■□□□ 1.7
SEH1L-202ENST00000399892 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SEH1L-202ENST00000399892 MED14O60244 1454 aa25.68■■□□□ 1.7
SEH1L-202ENST00000399892 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SEH1L-202ENST00000399892 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.64■■□□□ 1.7
SEH1L-202ENST00000399892 IFT172Q9UG01 1749 aa25.63■■□□□ 1.69
SEH1L-202ENST00000399892 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.62■■□□□ 1.69
SEH1L-202ENST00000399892 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.61■■□□□ 1.69
SEH1L-202ENST00000399892 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.6■■□□□ 1.69
SEH1L-202ENST00000399892 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.59■■□□□ 1.69
SEH1L-202ENST00000399892 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.56■■□□□ 1.68
SEH1L-202ENST00000399892 TONSLQ96HA7 1378 aa25.56■■□□□ 1.68
SEH1L-202ENST00000399892 STAC3Q96MF2 364 aa25.55■■□□□ 1.68
SEH1L-202ENST00000399892 MYOM2P54296 1465 aa25.55■■□□□ 1.68
SEH1L-202ENST00000399892 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.53■■□□□ 1.68
SEH1L-202ENST00000399892 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.52■■□□□ 1.68
SEH1L-202ENST00000399892 DIP2AQ14689 1571 aa25.52■■□□□ 1.68
SEH1L-202ENST00000399892 TBX22Q9Y458 520 aa25.51■■□□□ 1.67
SEH1L-202ENST00000399892 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.51■■□□□ 1.67
SEH1L-202ENST00000399892 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.5■■□□□ 1.67
SEH1L-202ENST00000399892 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SEH1L-202ENST00000399892 PIK3C2GO75747 1445 aa25.48■■□□□ 1.67
SEH1L-202ENST00000399892 ALKQ9UM73 1620 aa25.47■■□□□ 1.67
SEH1L-202ENST00000399892 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.45■■□□□ 1.67
SEH1L-202ENST00000399892 LAMC1P11047 1609 aa25.43■■□□□ 1.66
SEH1L-202ENST00000399892 PIK3R4Q99570 1358 aa25.42■■□□□ 1.66
SEH1L-202ENST00000399892 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SEH1L-202ENST00000399892 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.41■■□□□ 1.66
SEH1L-202ENST00000399892 METP08581 1390 aa25.41■■□□□ 1.66
SEH1L-202ENST00000399892 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SEH1L-202ENST00000399892 KCNA6P17658 529 aa25.4■■□□□ 1.66
SEH1L-202ENST00000399892 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SEH1L-202ENST00000399892 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.38■■□□□ 1.65
SEH1L-202ENST00000399892 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.38■■□□□ 1.65
SEH1L-202ENST00000399892 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.38■■□□□ 1.65
SEH1L-202ENST00000399892 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.37■■□□□ 1.65
SEH1L-202ENST00000399892 CPS1P31327 1500 aa25.36■■□□□ 1.65
SEH1L-202ENST00000399892 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.35■■□□□ 1.65
SEH1L-202ENST00000399892 NWD1Q149M9 1564 aa25.34■■□□□ 1.65
SEH1L-202ENST00000399892 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.34■■□□□ 1.65
SEH1L-202ENST00000399892 PTPRUQ92729 1446 aa25.33■■□□□ 1.65
SEH1L-202ENST00000399892 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.33■■□□□ 1.65
SEH1L-202ENST00000399892 STK26Q9P289 416 aa25.32■■□□□ 1.64
SEH1L-202ENST00000399892 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SEH1L-202ENST00000399892 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SEH1L-202ENST00000399892 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SEH1L-202ENST00000399892 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.29■■□□□ 1.64
SEH1L-202ENST00000399892 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SEH1L-202ENST00000399892 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SEH1L-202ENST00000399892 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.27■■□□□ 1.64
SEH1L-202ENST00000399892 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.27■■□□□ 1.64
SEH1L-202ENST00000399892 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.26■■□□□ 1.63
SEH1L-202ENST00000399892 CERKQ8TCT0 537 aa25.26■■□□□ 1.63
SEH1L-202ENST00000399892 ADGRB1O14514 1584 aa25.25■■□□□ 1.63
SEH1L-202ENST00000399892 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.25■■□□□ 1.63
SEH1L-202ENST00000399892 C14orf37Q86TY3 774 aa25.25■■□□□ 1.63
SEH1L-202ENST00000399892 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SEH1L-202ENST00000399892 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SEH1L-202ENST00000399892 TMEM94Q12767 1356 aa25.23■■□□□ 1.63
SEH1L-202ENST00000399892 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.23■■□□□ 1.63
SEH1L-202ENST00000399892 ABCC11Q96J66 1382 aa25.23■■□□□ 1.63
SEH1L-202ENST00000399892 PTCH1Q13635 1447 aa25.22■■□□□ 1.63
SEH1L-202ENST00000399892 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.22■■□□□ 1.63
SEH1L-202ENST00000399892 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.2■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 TECPR2O15040 1411 aa25.2■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.18■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 POGKQ9P215 609 aa25.17■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.16■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.16■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.16■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.15■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 MSH6P52701 1360 aa25.15■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 DLC1Q96QB1 1528 aa25.15■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 SIRT1Q96EB6 747 aa25.14■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 PRAM1Q96QH2 718 aa25.14■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.14■■□□□ 1.62
SEH1L-202ENST00000399892 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.61
SEH1L-202ENST00000399892 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SEH1L-202ENST00000399892 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.12■■□□□ 1.61
SEH1L-202ENST00000399892 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.11■■□□□ 1.61
SEH1L-202ENST00000399892 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.1■■□□□ 1.61
SEH1L-202ENST00000399892 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.09■■□□□ 1.61
SEH1L-202ENST00000399892 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
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