RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399683.7

C20orf27-204, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

TSL 2

Gene C20orf27, Length 933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-204ENST00000399683 HSPA2P54652 639 aa23.97■■□□□ 1.43
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C20orf27-204ENST00000399683 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.93■■□□□ 1.42
C20orf27-204ENST00000399683 MYOM2P54296 1465 aa23.93■■□□□ 1.42
C20orf27-204ENST00000399683 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
C20orf27-204ENST00000399683 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.92■■□□□ 1.42
C20orf27-204ENST00000399683 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
C20orf27-204ENST00000399683 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.91■■□□□ 1.42
C20orf27-204ENST00000399683 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.89■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.89■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 EID1Q9Y6B2 187 aa23.89■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 DIP2AQ14689 1571 aa23.89■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 LAMC1P11047 1609 aa23.88■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.87■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.87■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 LTKP29376 864 aa23.86■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 RGL3Q3MIN7 710 aa23.86■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.85■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.84■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 NEUROD1Q13562 356 aa23.83■■□□□ 1.41
C20orf27-204ENST00000399683 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.83■■□□□ 1.4
C20orf27-204ENST00000399683 TONSLQ96HA7 1378 aa23.81■■□□□ 1.4
C20orf27-204ENST00000399683 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
C20orf27-204ENST00000399683 STAC3Q96MF2 364 aa23.81■■□□□ 1.4
C20orf27-204ENST00000399683 PIK3C2GO75747 1445 aa23.81■■□□□ 1.4
C20orf27-204ENST00000399683 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
C20orf27-204ENST00000399683 ALKQ9UM73 1620 aa23.77■■□□□ 1.4
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C20orf27-204ENST00000399683 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
C20orf27-204ENST00000399683 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.77■■□□□ 1.4
C20orf27-204ENST00000399683 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.75■■□□□ 1.39
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C20orf27-204ENST00000399683 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.75■■□□□ 1.39
C20orf27-204ENST00000399683 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.75■■□□□ 1.39
C20orf27-204ENST00000399683 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.75■■□□□ 1.39
C20orf27-204ENST00000399683 NWD1Q149M9 1564 aa23.74■■□□□ 1.39
C20orf27-204ENST00000399683 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.73■■□□□ 1.39
C20orf27-204ENST00000399683 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.72■■□□□ 1.39
C20orf27-204ENST00000399683 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.71■■□□□ 1.39
C20orf27-204ENST00000399683 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
C20orf27-204ENST00000399683 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.7■■□□□ 1.38
C20orf27-204ENST00000399683 PIK3R4Q99570 1358 aa23.68■■□□□ 1.38
C20orf27-204ENST00000399683 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.68■■□□□ 1.38
C20orf27-204ENST00000399683 TBX22Q9Y458 520 aa23.67■■□□□ 1.38
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C20orf27-204ENST00000399683 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.64■■□□□ 1.37
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C20orf27-204ENST00000399683 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
C20orf27-204ENST00000399683 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.59■■□□□ 1.37
C20orf27-204ENST00000399683 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
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C20orf27-204ENST00000399683 TECPR2O15040 1411 aa23.57■■□□□ 1.36
C20orf27-204ENST00000399683 PTCH1Q13635 1447 aa23.56■■□□□ 1.36
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C20orf27-204ENST00000399683 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
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C20orf27-204ENST00000399683 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.54■■□□□ 1.36
C20orf27-204ENST00000399683 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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C20orf27-204ENST00000399683 ABCC11Q96J66 1382 aa23.5■■□□□ 1.35
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C20orf27-204ENST00000399683 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.44■■□□□ 1.34
C20orf27-204ENST00000399683 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.43■■□□□ 1.34
C20orf27-204ENST00000399683 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.42■■□□□ 1.34
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C20orf27-204ENST00000399683 ADGRB2O60241 1585 aa23.41■■□□□ 1.34
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C20orf27-204ENST00000399683 STK26Q9P289 416 aa23.4■■□□□ 1.34
C20orf27-204ENST00000399683 TMEM94Q12767 1356 aa23.39■■□□□ 1.33
C20orf27-204ENST00000399683 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
C20orf27-204ENST00000399683 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.38■■□□□ 1.33
C20orf27-204ENST00000399683 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.38■■□□□ 1.33
C20orf27-204ENST00000399683 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.37■■□□□ 1.33
C20orf27-204ENST00000399683 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
C20orf27-204ENST00000399683 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
C20orf27-204ENST00000399683 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.35■■□□□ 1.33
C20orf27-204ENST00000399683 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.34■■□□□ 1.33
C20orf27-204ENST00000399683 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.34■■□□□ 1.33
C20orf27-204ENST00000399683 DCCP43146 1447 aa23.33■■□□□ 1.33
C20orf27-204ENST00000399683 USP47Q96K76 1375 aa23.31■■□□□ 1.32
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