RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.46■■□□□ 1.19
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.45■■□□□ 1.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.45■■□□□ 1.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLTCL1P53675 1640 aa22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.43■■□□□ 1.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.39■■□□□ 1.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCANQ96GW7 911 aa22.35■■□□□ 1.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IQGAP1P46940 1657 aa22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBX22Q9Y458 520 aa22.34■■□□□ 1.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.32■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.31■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGL3Q3MIN7 710 aa22.31■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.31■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.31■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CERKQ8TCT0 537 aa22.29■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STAC3Q96MF2 364 aa22.29■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIK3R4Q99570 1358 aa22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.28■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CPS1P31327 1500 aa22.27■■□□□ 1.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DIP2AQ14689 1571 aa22.26■■□□□ 1.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNA6P17658 529 aa22.26■■□□□ 1.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.25■■□□□ 1.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIF1BO60333 1816 aa22.24■■□□□ 1.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.24■■□□□ 1.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYOM2P54296 1465 aa22.21■■□□□ 1.15
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.19■■□□□ 1.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.17■■□□□ 1.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIK3C2GO75747 1445 aa22.17■■□□□ 1.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.16■■□□□ 1.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 METP08581 1390 aa22.15■■□□□ 1.14
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NWD1Q149M9 1564 aa22.14■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.14■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.14■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.13■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXO41Q8TF61 875 aa22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPLO60437 1756 aa22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALKQ9UM73 1620 aa22.1■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.1■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTPRUQ92729 1446 aa22.1■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM94Q12767 1356 aa22.1■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEUROD1Q13562 356 aa22.08■■□□□ 1.13
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFT172Q9UG01 1749 aa22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.06■■□□□ 1.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTCH1Q13635 1447 aa22.05■■□□□ 1.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOM1O60784 492 aa22.04■■□□□ 1.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCC11Q96J66 1382 aa22.03■■□□□ 1.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TECPR2O15040 1411 aa22.02■■□□□ 1.12
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MSH6P52701 1360 aa22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TONSLQ96HA7 1378 aa22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIRT1Q96EB6 747 aa22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.01■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAMC1P11047 1609 aa21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.99■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C14orf37Q86TY3 774 aa21.98■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STK26Q9P289 416 aa21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.96■■□□□ 1.11
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.95■■□□□ 1.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCCP43146 1447 aa21.95■■□□□ 1.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADGRB1O14514 1584 aa21.94■■□□□ 1.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATF3P18847 181 aa21.92■■□□□ 1.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DLC1Q96QB1 1528 aa21.9■■□□□ 1.1
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLAIN2Q9P270 581 aa21.87■■□□□ 1.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIP4K2BP78356 416 aa21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRAM1Q96QH2 718 aa21.86■■□□□ 1.09
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.86■■□□□ 1.09
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