RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392929.6

CCNT2-AS1-201, CCNT2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene CCNT2-AS1, Length 544 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NUP155O75694 1391 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ZFYVE9O95405 1425 aa24.4■■□□□ 1.5
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NWD1Q149M9 1564 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 KCNA6P17658 529 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 TMEM94Q12767 1356 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.36■■□□□ 1.49
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 SOCS7O14512 581 aa24.32■■□□□ 1.48
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 DIP2AQ14689 1571 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 MSH6P52701 1360 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NAIPQ13075 1403 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.23■■□□□ 1.47
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 TBX22Q9Y458 520 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 TRPM2O94759 1503 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 CLTCL1P53675 1640 aa24.2■■□□□ 1.46
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 C14orf37Q86TY3 774 aa24.19■■□□□ 1.46
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 KIF1BO60333 1816 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 TRIM52Q96A61 297 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 HFM1A2PYH4 1435 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 PIK3R4Q99570 1358 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.14■■□□□ 1.46
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 PHLPP1O60346 1717 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 SLAIN2Q9P270 581 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.09■■□□□ 1.45
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 PTPRUQ92729 1446 aa24.09■■□□□ 1.45
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ATF3P18847 181 aa24.06■■□□□ 1.44
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.05■■□□□ 1.44
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.04■■□□□ 1.44
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 METP08581 1390 aa24.02■■□□□ 1.44
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 JCADQ9P266 1359 aa23.98■■□□□ 1.43
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 PPLO60437 1756 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 DCCP43146 1447 aa23.97■■□□□ 1.43
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.96■■□□□ 1.43
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 FOXD1Q16676 465 aa23.95■■□□□ 1.42
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.92■■□□□ 1.42
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.91■■□□□ 1.42
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 SHPRHQ149N8 1683 aa23.9■■□□□ 1.42
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 BRINP3Q76B58 766 aa23.9■■□□□ 1.42
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 MST1RQ04912 1400 aa23.9■■□□□ 1.42
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.87■■□□□ 1.41
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 PTCH1Q13635 1447 aa23.86■■□□□ 1.41
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.85■■□□□ 1.41
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 LRP6O75581 1613 aa23.85■■□□□ 1.41
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 POTEAQ6S8J7 498 aa23.85■■□□□ 1.41
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.85■■□□□ 1.41
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 RGL3Q3MIN7 710 aa23.83■■□□□ 1.41
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 IFT172Q9UG01 1749 aa23.83■■□□□ 1.41
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.82■■□□□ 1.4
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.8■■□□□ 1.4
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.79■■□□□ 1.4
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.78■■□□□ 1.4
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.77■■□□□ 1.4
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.77■■□□□ 1.4
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.77■■□□□ 1.4
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.72■■□□□ 1.39
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.71■■□□□ 1.39
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 STK26Q9P289 416 aa23.71■■□□□ 1.39
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.7■■□□□ 1.39
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 PIK3C2GO75747 1445 aa23.7■■□□□ 1.38
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 ORAI2Q96SN7 254 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 LAMC1P11047 1609 aa23.69■■□□□ 1.38
CCNT2-AS1-201ENST00000392929 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms