RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRK-208ENST00000392449 NUP155O75694 1391 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRK-208ENST00000392449 ZFYVE9O95405 1425 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRK-208ENST00000392449 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRK-208ENST00000392449 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRK-208ENST00000392449 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRK-208ENST00000392449 BCANQ96GW7 911 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRK-208ENST00000392449 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRK-208ENST00000392449 TMEM94Q12767 1356 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRK-208ENST00000392449 KCNA6P17658 529 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRK-208ENST00000392449 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRK-208ENST00000392449 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRK-208ENST00000392449 NWD1Q149M9 1564 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRK-208ENST00000392449 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRK-208ENST00000392449 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRK-208ENST00000392449 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRK-208ENST00000392449 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-208ENST00000392449 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-208ENST00000392449 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRK-208ENST00000392449 SOCS7O14512 581 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-208ENST00000392449 NAIPQ13075 1403 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRK-208ENST00000392449 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-208ENST00000392449 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRK-208ENST00000392449 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
PTPRK-208ENST00000392449 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRK-208ENST00000392449 TBX22Q9Y458 520 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRK-208ENST00000392449 CLTCL1P53675 1640 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRK-208ENST00000392449 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRK-208ENST00000392449 MSH6P52701 1360 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRK-208ENST00000392449 DIP2AQ14689 1571 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRK-208ENST00000392449 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRK-208ENST00000392449 HFM1A2PYH4 1435 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-208ENST00000392449 TRPM2O94759 1503 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-208ENST00000392449 PTPRUQ92729 1446 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRK-208ENST00000392449 TRIM52Q96A61 297 aa25.08■■□□□ 1.6
PTPRK-208ENST00000392449 SLAIN2Q9P270 581 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRK-208ENST00000392449 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRK-208ENST00000392449 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-208ENST00000392449 C14orf37Q86TY3 774 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-208ENST00000392449 PIK3R4Q99570 1358 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRK-208ENST00000392449 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRK-208ENST00000392449 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRK-208ENST00000392449 KIF1BO60333 1816 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRK-208ENST00000392449 PHLPP1O60346 1717 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-208ENST00000392449 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PTPRK-208ENST00000392449 METP08581 1390 aa25■■□□□ 1.59
PTPRK-208ENST00000392449 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRK-208ENST00000392449 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PTPRK-208ENST00000392449 FOXD1Q16676 465 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRK-208ENST00000392449 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PTPRK-208ENST00000392449 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.95■■□□□ 1.58
PTPRK-208ENST00000392449 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRK-208ENST00000392449 ATF3P18847 181 aa24.93■■□□□ 1.58
PTPRK-208ENST00000392449 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRK-208ENST00000392449 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
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PTPRK-208ENST00000392449 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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PTPRK-208ENST00000392449 DCCP43146 1447 aa24.84■■□□□ 1.57
PTPRK-208ENST00000392449 MST1RQ04912 1400 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRK-208ENST00000392449 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
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PTPRK-208ENST00000392449 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-208ENST00000392449 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRK-208ENST00000392449 LRP6O75581 1613 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRK-208ENST00000392449 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRK-208ENST00000392449 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRK-208ENST00000392449 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.79■■□□□ 1.56
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PTPRK-208ENST00000392449 RGL3Q3MIN7 710 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRK-208ENST00000392449 PTCH1Q13635 1447 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRK-208ENST00000392449 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRK-208ENST00000392449 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRK-208ENST00000392449 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRK-208ENST00000392449 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRK-208ENST00000392449 IFT172Q9UG01 1749 aa24.75■■□□□ 1.55
PTPRK-208ENST00000392449 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRK-208ENST00000392449 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRK-208ENST00000392449 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.7■■□□□ 1.54
PTPRK-208ENST00000392449 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.69■■□□□ 1.54
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PTPRK-208ENST00000392449 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-208ENST00000392449 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-208ENST00000392449 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PTPRK-208ENST00000392449 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.66■■□□□ 1.54
PTPRK-208ENST00000392449 ORAI2Q96SN7 254 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRK-208ENST00000392449 STK26Q9P289 416 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRK-208ENST00000392449 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.64■■□□□ 1.53
PTPRK-208ENST00000392449 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRK-208ENST00000392449 PIK3C2GO75747 1445 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRK-208ENST00000392449 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRK-208ENST00000392449 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRK-208ENST00000392449 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PTPRK-208ENST00000392449 LAMC1P11047 1609 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRK-208ENST00000392449 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRK-208ENST00000392449 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.59■■□□□ 1.53
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