RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380272.3

FAM50B-201, Transcript of family with sequence similarity 50 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM50B, Length 1,628 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50B-201ENST00000380272 CCER2I3L3R5 266 aa25.47■■□□□ 1.67
FAM50B-201ENST00000380272 USP47Q96K76 1375 aa25.46■■□□□ 1.67
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FAM50B-201ENST00000380272 TRPM2O94759 1503 aa25.43■■□□□ 1.66
FAM50B-201ENST00000380272 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
FAM50B-201ENST00000380272 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.43■■□□□ 1.66
FAM50B-201ENST00000380272 RGL3Q3MIN7 710 aa25.42■■□□□ 1.66
FAM50B-201ENST00000380272 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.42■■□□□ 1.66
FAM50B-201ENST00000380272 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.42■■□□□ 1.66
FAM50B-201ENST00000380272 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
FAM50B-201ENST00000380272 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.4■■□□□ 1.66
FAM50B-201ENST00000380272 STAC3Q96MF2 364 aa25.4■■□□□ 1.66
FAM50B-201ENST00000380272 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.4■■□□□ 1.66
FAM50B-201ENST00000380272 IDI1Q13907 227 aa25.39■■□□□ 1.66
FAM50B-201ENST00000380272 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.39■■□□□ 1.65
FAM50B-201ENST00000380272 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.38■■□□□ 1.65
FAM50B-201ENST00000380272 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
FAM50B-201ENST00000380272 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
FAM50B-201ENST00000380272 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.36■■□□□ 1.65
FAM50B-201ENST00000380272 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
FAM50B-201ENST00000380272 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
FAM50B-201ENST00000380272 ADGRB3O60242 1522 aa25.33■■□□□ 1.65
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FAM50B-201ENST00000380272 LAMC1P11047 1609 aa25.31■■□□□ 1.64
FAM50B-201ENST00000380272 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM50B-201ENST00000380272 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.3■■□□□ 1.64
FAM50B-201ENST00000380272 SLIT1O75093 1534 aa25.3■■□□□ 1.64
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FAM50B-201ENST00000380272 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM50B-201ENST00000380272 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.29■■□□□ 1.64
FAM50B-201ENST00000380272 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.26■■□□□ 1.63
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FAM50B-201ENST00000380272 LTKP29376 864 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM50B-201ENST00000380272 IQGAP1P46940 1657 aa25.25■■□□□ 1.63
FAM50B-201ENST00000380272 MED14O60244 1454 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM50B-201ENST00000380272 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM50B-201ENST00000380272 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM50B-201ENST00000380272 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM50B-201ENST00000380272 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
FAM50B-201ENST00000380272 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
FAM50B-201ENST00000380272 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.2■■□□□ 1.62
FAM50B-201ENST00000380272 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.19■■□□□ 1.62
FAM50B-201ENST00000380272 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.18■■□□□ 1.62
FAM50B-201ENST00000380272 KIF1BO60333 1816 aa25.18■■□□□ 1.62
FAM50B-201ENST00000380272 ZFYVE9O95405 1425 aa25.17■■□□□ 1.62
FAM50B-201ENST00000380272 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
FAM50B-201ENST00000380272 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
FAM50B-201ENST00000380272 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
FAM50B-201ENST00000380272 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.13■■□□□ 1.61
FAM50B-201ENST00000380272 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.13■■□□□ 1.61
FAM50B-201ENST00000380272 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.13■■□□□ 1.61
FAM50B-201ENST00000380272 MYOM2P54296 1465 aa25.13■■□□□ 1.61
FAM50B-201ENST00000380272 EID1Q9Y6B2 187 aa25.12■■□□□ 1.61
FAM50B-201ENST00000380272 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.11■■□□□ 1.61
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FAM50B-201ENST00000380272 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.02■■□□□ 1.6
FAM50B-201ENST00000380272 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.02■■□□□ 1.6
FAM50B-201ENST00000380272 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.01■■□□□ 1.59
FAM50B-201ENST00000380272 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.01■■□□□ 1.59
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FAM50B-201ENST00000380272 PPLO60437 1756 aa25■■□□□ 1.59
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FAM50B-201ENST00000380272 SLC24A1O60721 1099 aa24.99■■□□□ 1.59
FAM50B-201ENST00000380272 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.98■■□□□ 1.59
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FAM50B-201ENST00000380272 MRS2Q9HD23 443 aa24.97■■□□□ 1.59
FAM50B-201ENST00000380272 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.96■■□□□ 1.59
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FAM50B-201ENST00000380272 CCDC184Q52MB2 194 aa24.92■■□□□ 1.58
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FAM50B-201ENST00000380272 DIP2AQ14689 1571 aa24.9■■□□□ 1.58
FAM50B-201ENST00000380272 FBXO41Q8TF61 875 aa24.9■■□□□ 1.58
FAM50B-201ENST00000380272 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
FAM50B-201ENST00000380272 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
FAM50B-201ENST00000380272 PIK3C2GO75747 1445 aa24.89■■□□□ 1.57
FAM50B-201ENST00000380272 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
FAM50B-201ENST00000380272 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
FAM50B-201ENST00000380272 TBX22Q9Y458 520 aa24.86■■□□□ 1.57
FAM50B-201ENST00000380272 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
FAM50B-201ENST00000380272 KCNA6P17658 529 aa24.85■■□□□ 1.57
FAM50B-201ENST00000380272 PTPRUQ92729 1446 aa24.84■■□□□ 1.57
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