RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.26■■■■□ 3.39
SNX15-202ENST00000377244 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
SNX15-202ENST00000377244 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.25■■■■□ 3.39
SNX15-202ENST00000377244 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
SNX15-202ENST00000377244 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
SNX15-202ENST00000377244 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.2■■■■□ 3.39
SNX15-202ENST00000377244 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.19■■■■□ 3.38
SNX15-202ENST00000377244 STAC3Q96MF2 364 aa36.18■■■■□ 3.38
SNX15-202ENST00000377244 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.18■■■■□ 3.38
SNX15-202ENST00000377244 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.18■■■■□ 3.38
SNX15-202ENST00000377244 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
SNX15-202ENST00000377244 ZFYVE9O95405 1425 aa36.16■■■■□ 3.38
SNX15-202ENST00000377244 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
SNX15-202ENST00000377244 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.14■■■■□ 3.38
SNX15-202ENST00000377244 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
SNX15-202ENST00000377244 PIK3C2GO75747 1445 aa36.12■■■■□ 3.37
SNX15-202ENST00000377244 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.12■■■■□ 3.37
SNX15-202ENST00000377244 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
SNX15-202ENST00000377244 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.07■■■■□ 3.36
SNX15-202ENST00000377244 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
SNX15-202ENST00000377244 SLIT1O75093 1534 aa36.05■■■■□ 3.36
SNX15-202ENST00000377244 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.04■■■■□ 3.36
SNX15-202ENST00000377244 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.03■■■■□ 3.36
SNX15-202ENST00000377244 LTKP29376 864 aa36.02■■■■□ 3.36
SNX15-202ENST00000377244 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.02■■■■□ 3.36
SNX15-202ENST00000377244 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.01■■■■□ 3.36
SNX15-202ENST00000377244 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
SNX15-202ENST00000377244 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.99■■■■□ 3.35
SNX15-202ENST00000377244 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.98■■■■□ 3.35
SNX15-202ENST00000377244 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
SNX15-202ENST00000377244 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
SNX15-202ENST00000377244 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.95■■■■□ 3.35
SNX15-202ENST00000377244 EID1Q9Y6B2 187 aa35.94■■■■□ 3.34
SNX15-202ENST00000377244 IQGAP1P46940 1657 aa35.94■■■■□ 3.34
SNX15-202ENST00000377244 USP47Q96K76 1375 aa35.93■■■■□ 3.34
SNX15-202ENST00000377244 LAMC1P11047 1609 aa35.93■■■■□ 3.34
SNX15-202ENST00000377244 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
SNX15-202ENST00000377244 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.92■■■■□ 3.34
SNX15-202ENST00000377244 ALKQ9UM73 1620 aa35.92■■■■□ 3.34
SNX15-202ENST00000377244 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
SNX15-202ENST00000377244 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.91■■■■□ 3.34
SNX15-202ENST00000377244 ADGRB1O14514 1584 aa35.9■■■■□ 3.34
SNX15-202ENST00000377244 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.89■■■■□ 3.34
SNX15-202ENST00000377244 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.89■■■■□ 3.34
SNX15-202ENST00000377244 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.88■■■■□ 3.33
SNX15-202ENST00000377244 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
SNX15-202ENST00000377244 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
SNX15-202ENST00000377244 BCANQ96GW7 911 aa35.87■■■■□ 3.33
SNX15-202ENST00000377244 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.83■■■■□ 3.33
SNX15-202ENST00000377244 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.83■■■■□ 3.33
SNX15-202ENST00000377244 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.82■■■■□ 3.32
SNX15-202ENST00000377244 HSPA2P54652 639 aa35.81■■■■□ 3.32
SNX15-202ENST00000377244 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
SNX15-202ENST00000377244 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.77■■■■□ 3.32
SNX15-202ENST00000377244 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.77■■■■□ 3.32
SNX15-202ENST00000377244 METP08581 1390 aa35.76■■■■□ 3.31
SNX15-202ENST00000377244 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.75■■■■□ 3.31
SNX15-202ENST00000377244 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.74■■■■□ 3.31
SNX15-202ENST00000377244 STK26Q9P289 416 aa35.73■■■■□ 3.31
SNX15-202ENST00000377244 MED14O60244 1454 aa35.73■■■■□ 3.31
SNX15-202ENST00000377244 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
SNX15-202ENST00000377244 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
SNX15-202ENST00000377244 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
SNX15-202ENST00000377244 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
SNX15-202ENST00000377244 DIP2AQ14689 1571 aa35.66■■■■□ 3.3
SNX15-202ENST00000377244 TBX22Q9Y458 520 aa35.63■■■■□ 3.29
SNX15-202ENST00000377244 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
SNX15-202ENST00000377244 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
SNX15-202ENST00000377244 TESK2Q96S53 571 aa35.61■■■■□ 3.29
SNX15-202ENST00000377244 PTPRUQ92729 1446 aa35.6■■■■□ 3.29
SNX15-202ENST00000377244 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
SNX15-202ENST00000377244 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.56■■■■□ 3.28
SNX15-202ENST00000377244 STRCQ7RTU9 1775 aa35.56■■■■□ 3.28
SNX15-202ENST00000377244 ABCC11Q96J66 1382 aa35.56■■■■□ 3.28
SNX15-202ENST00000377244 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.55■■■■□ 3.28
SNX15-202ENST00000377244 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.55■■■■□ 3.28
SNX15-202ENST00000377244 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.55■■■■□ 3.28
SNX15-202ENST00000377244 PRAM1Q96QH2 718 aa35.53■■■■□ 3.28
SNX15-202ENST00000377244 DLC1Q96QB1 1528 aa35.52■■■■□ 3.28
SNX15-202ENST00000377244 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.51■■■■□ 3.28
SNX15-202ENST00000377244 TECPR2O15040 1411 aa35.51■■■■□ 3.28
SNX15-202ENST00000377244 CPS1P31327 1500 aa35.5■■■■□ 3.27
SNX15-202ENST00000377244 KIF7Q2M1P5 1343 aa35.5■■■■□ 3.27
SNX15-202ENST00000377244 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.5■■■■□ 3.27
SNX15-202ENST00000377244 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.49■■■■□ 3.27
SNX15-202ENST00000377244 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.49■■■■□ 3.27
SNX15-202ENST00000377244 CCDC7Q96M83 1385 aa35.49■■■■□ 3.27
SNX15-202ENST00000377244 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.48■■■■□ 3.27
SNX15-202ENST00000377244 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
SNX15-202ENST00000377244 POGKQ9P215 609 aa35.47■■■■□ 3.27
SNX15-202ENST00000377244 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
SNX15-202ENST00000377244 PIK3R4Q99570 1358 aa35.46■■■■□ 3.27
SNX15-202ENST00000377244 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.45■■■■□ 3.27
SNX15-202ENST00000377244 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.44■■■■□ 3.26
SNX15-202ENST00000377244 TMF1P82094 1093 aa35.43■■■■□ 3.26
SNX15-202ENST00000377244 KCNA6P17658 529 aa35.42■■■■□ 3.26
SNX15-202ENST00000377244 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.41■■■■□ 3.26
SNX15-202ENST00000377244 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
SNX15-202ENST00000377244 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
SNX15-202ENST00000377244 PTCH1Q13635 1447 aa35.38■■■■□ 3.25
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