RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371421.8

ARRDC1-201, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1, Length 1,586 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-201ENST00000371421 STAC3Q96MF2 364 aa41.26■■■■■ 4.2
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ARRDC1-201ENST00000371421 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.25■■■■■ 4.19
ARRDC1-201ENST00000371421 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.24■■■■■ 4.19
ARRDC1-201ENST00000371421 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.24■■■■■ 4.19
ARRDC1-201ENST00000371421 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.24■■■■■ 4.19
ARRDC1-201ENST00000371421 ZFYVE9O95405 1425 aa41.24■■■■■ 4.19
ARRDC1-201ENST00000371421 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
ARRDC1-201ENST00000371421 EID1Q9Y6B2 187 aa41.23■■■■■ 4.19
ARRDC1-201ENST00000371421 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
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ARRDC1-201ENST00000371421 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.18■■■■■ 4.18
ARRDC1-201ENST00000371421 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
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ARRDC1-201ENST00000371421 LTKP29376 864 aa41.16■■■■■ 4.18
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ARRDC1-201ENST00000371421 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.02■■■■■ 4.16
ARRDC1-201ENST00000371421 BCANQ96GW7 911 aa41■■■■■ 4.15
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ARRDC1-201ENST00000371421 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
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ARRDC1-201ENST00000371421 LAMC1P11047 1609 aa40.8■■■■■ 4.12
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ARRDC1-201ENST00000371421 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.78■■■■■ 4.12
ARRDC1-201ENST00000371421 RALGAPBQ86X10 1494 aa40.77■■■■■ 4.12
ARRDC1-201ENST00000371421 DIP2AQ14689 1571 aa40.76■■■■■ 4.12
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ARRDC1-201ENST00000371421 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.39■■■■■ 4.06
ARRDC1-201ENST00000371421 PTCH1Q13635 1447 aa40.39■■■■■ 4.06
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ARRDC1-201ENST00000371421 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa40.18■■■■■ 4.02
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