RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370206.8

CNN3-201, Transcript of calponin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNN3, Length 2,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-201ENST00000370206 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.32
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CNN3-201ENST00000370206 PDE3BQ13370 1112 aa29.52■■■□□ 2.32
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CNN3-201ENST00000370206 NOS1P29475 1434 aa29.33■■■□□ 2.29
CNN3-201ENST00000370206 CDCA7LQ96GN5 454 aa29.32■■■□□ 2.28
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CNN3-201ENST00000370206 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.24■■■□□ 2.27
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CNN3-201ENST00000370206 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.21■■■□□ 2.27
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CNN3-201ENST00000370206 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.08■■■□□ 2.25
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CNN3-201ENST00000370206 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CNN3-201ENST00000370206 MORC1Q86VD1 984 aa28.93■■■□□ 2.22
CNN3-201ENST00000370206 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.92■■■□□ 2.22
CNN3-201ENST00000370206 EVC2Q86UK5 1308 aa28.92■■■□□ 2.22
CNN3-201ENST00000370206 SHPRHQ149N8 1683 aa28.91■■■□□ 2.22
CNN3-201ENST00000370206 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.91■■■□□ 2.22
CNN3-201ENST00000370206 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
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