RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 KIF14Q15058 1648 aa9.69□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.69□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 PYGBP11216 843 aa9.69□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 BECN1Q14457 450 aa9.68□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.68□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 ZMYM3Q14202 1370 aa9.68□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 NLRP13Q86W25 1043 aa9.67□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 AAMPQ13685 434 aa9.67□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.67□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa9.67□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 MBD5Q9P267 1494 aa9.67□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 USP47Q96K76 1375 aa9.66□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 EXOC6Q8TAG9 804 aa9.66□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.66□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.66□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.65□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 KDM5CP41229 1560 aa9.65□□□□□ -0.86
GABPB2-201ENST00000368916 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.65□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 NGEFQ8N5V2 710 aa9.64□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.64□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.64□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 PTGER2P43116 358 aa9.63□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.62□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 CLCN1P35523 988 aa9.62□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 P3H3Q8IVL6 736 aa9.61□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.61□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.61□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.61□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.61□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 PTMSP20962 102 aa9.61□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 IFNL1Q8IU54 200 aa9.61□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 DAPK1P53355 1430 aa9.6□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.6□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 E9PCH4 1651 aa9.6□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.59□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa9.59□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 RGL2O15211 777 aa9.59□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 OCEL1Q9H607 264 aa9.59□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GABPB2-201ENST00000368916 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.58□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 TPM2P07951 284 aa9.57□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 C8orf34Q49A92 452 aa9.57□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 NESP48681 1621 aa9.57□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 ADGRL2O95490 1459 aa9.57□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.56□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 MRE11P49959 708 aa9.56□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 TERF1P54274 439 aa9.56□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 ADGBQ8N7X0 1667 aa9.55□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 MAP7D2Q96T17 732 aa9.55□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.55□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 LAMC1P11047 1609 aa9.55□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.55□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.55□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 CRBNQ96SW2 442 aa9.55□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.55□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 KDM6BO15054 1643 aa9.54□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 ABCC5O15440 1437 aa9.54□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa9.54□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 SLC24A1O60721 1099 aa9.54□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.54□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.54□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 SCAPERQ9BY12 1400 aa9.53□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 PZPP20742 1482 aa9.53□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 TOPBP1Q92547 1522 aa9.53□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.53□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.53□□□□□ -0.88
GABPB2-201ENST00000368916 FSD2A1L4K1 749 aa9.52□□□□□ -0.89
GABPB2-201ENST00000368916 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GABPB2-201ENST00000368916 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GABPB2-201ENST00000368916 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.52□□□□□ -0.89
GABPB2-201ENST00000368916 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.51□□□□□ -0.89
GABPB2-201ENST00000368916 PDE3AQ14432 1141 aa9.51□□□□□ -0.89
GABPB2-201ENST00000368916 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.51□□□□□ -0.89
GABPB2-201ENST00000368916 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.51□□□□□ -0.89
GABPB2-201ENST00000368916 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GABPB2-201ENST00000368916 ZMYND15Q9H091 742 aa9.51□□□□□ -0.89
GABPB2-201ENST00000368916 GOLGA2Q08379 1002 aa9.5□□□□□ -0.89
GABPB2-201ENST00000368916 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GABPB2-201ENST00000368916 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.5□□□□□ -0.89
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