RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367760.7

PRRX1-202, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 2,217 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-202ENST00000367760 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PRRX1-202ENST00000367760 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PRRX1-202ENST00000367760 PANK3Q9H999 370 aa22.84■■□□□ 1.25
PRRX1-202ENST00000367760 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.84■■□□□ 1.25
PRRX1-202ENST00000367760 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.83■■□□□ 1.25
PRRX1-202ENST00000367760 SYNMO15061 1565 aa22.82■■□□□ 1.24
PRRX1-202ENST00000367760 NEO1Q92859 1461 aa22.82■■□□□ 1.24
PRRX1-202ENST00000367760 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.81■■□□□ 1.24
PRRX1-202ENST00000367760 IFT172Q9UG01 1749 aa22.8■■□□□ 1.24
PRRX1-202ENST00000367760 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.78■■□□□ 1.24
PRRX1-202ENST00000367760 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.77■■□□□ 1.24
PRRX1-202ENST00000367760 ABCA6Q8N139 1617 aa22.76■■□□□ 1.23
PRRX1-202ENST00000367760 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.76■■□□□ 1.23
PRRX1-202ENST00000367760 ADGRB3O60242 1522 aa22.76■■□□□ 1.23
PRRX1-202ENST00000367760 PDE3BQ13370 1112 aa22.75■■□□□ 1.23
PRRX1-202ENST00000367760 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PRRX1-202ENST00000367760 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRX1-202ENST00000367760 MROH2AA6NES4 1674 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRX1-202ENST00000367760 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PRRX1-202ENST00000367760 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRX1-202ENST00000367760 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PRRX1-202ENST00000367760 NPATQ14207 1427 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRX1-202ENST00000367760 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRX1-202ENST00000367760 ABCC3O15438 1527 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRX1-202ENST00000367760 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRX1-202ENST00000367760 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRX1-202ENST00000367760 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRX1-202ENST00000367760 MYOM1P52179 1685 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRX1-202ENST00000367760 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.68■■□□□ 1.22
PRRX1-202ENST00000367760 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRX1-202ENST00000367760 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRX1-202ENST00000367760 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PRRX1-202ENST00000367760 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRX1-202ENST00000367760 PPLO60437 1756 aa22.64■■□□□ 1.22
PRRX1-202ENST00000367760 NOS1P29475 1434 aa22.64■■□□□ 1.22
PRRX1-202ENST00000367760 GGT6Q6P531 493 aa22.64■■□□□ 1.21
PRRX1-202ENST00000367760 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRX1-202ENST00000367760 ERVK-7P63135 1459 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRX1-202ENST00000367760 PIK3C2GO75747 1445 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRX1-202ENST00000367760 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PRRX1-202ENST00000367760 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRX1-202ENST00000367760 RICTORQ6R327 1708 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRX1-202ENST00000367760 PPP2R1AP30153 589 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRX1-202ENST00000367760 GLI2P10070 1586 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRX1-202ENST00000367760 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRX1-202ENST00000367760 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRX1-202ENST00000367760 PIK3C2BO00750 1634 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRX1-202ENST00000367760 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
PRRX1-202ENST00000367760 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
PRRX1-202ENST00000367760 MSH5O43196 834 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRX1-202ENST00000367760 RAPGEF3O95398 923 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRX1-202ENST00000367760 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.57■■□□□ 1.2
PRRX1-202ENST00000367760 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PRRX1-202ENST00000367760 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PRRX1-202ENST00000367760 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
PRRX1-202ENST00000367760 ADGRB1O14514 1584 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRX1-202ENST00000367760 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.54■■□□□ 1.2
PRRX1-202ENST00000367760 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.53■■□□□ 1.2
PRRX1-202ENST00000367760 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.52■■□□□ 1.2
PRRX1-202ENST00000367760 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.51■■□□□ 1.19
PRRX1-202ENST00000367760 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PRRX1-202ENST00000367760 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PRRX1-202ENST00000367760 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.5■■□□□ 1.19
PRRX1-202ENST00000367760 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PRRX1-202ENST00000367760 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.48■■□□□ 1.19
PRRX1-202ENST00000367760 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.47■■□□□ 1.19
PRRX1-202ENST00000367760 ZFYVE9O95405 1425 aa22.47■■□□□ 1.19
PRRX1-202ENST00000367760 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PRRX1-202ENST00000367760 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.45■■□□□ 1.18
PRRX1-202ENST00000367760 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.45■■□□□ 1.18
PRRX1-202ENST00000367760 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.45■■□□□ 1.18
PRRX1-202ENST00000367760 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.43■■□□□ 1.18
PRRX1-202ENST00000367760 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.43■■□□□ 1.18
PRRX1-202ENST00000367760 NGEFQ8N5V2 710 aa22.42■■□□□ 1.18
PRRX1-202ENST00000367760 USP32Q8NFA0 1604 aa22.41■■□□□ 1.18
PRRX1-202ENST00000367760 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.4■■□□□ 1.18
PRRX1-202ENST00000367760 ZNF521Q96K83 1311 aa22.4■■□□□ 1.18
PRRX1-202ENST00000367760 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.39■■□□□ 1.18
PRRX1-202ENST00000367760 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 DIP2BQ9P265 1576 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 REREQ9P2R6 1566 aa22.39■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 IDI1Q13907 227 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 EVC2Q86UK5 1308 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.38■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 GOLGA2Q08379 1002 aa22.37■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.36■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.36■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.35■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 AGLP35573 1532 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.34■■□□□ 1.17
PRRX1-202ENST00000367760 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.33■■□□□ 1.16
PRRX1-202ENST00000367760 NSD2O96028 1365 aa22.32■■□□□ 1.16
PRRX1-202ENST00000367760 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.32■■□□□ 1.16
PRRX1-202ENST00000367760 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms