RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYO7AQ13402 2215 aa-1.17□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ABCA4P78363 2273 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POTECB2RU33 542 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT2P35908 639 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PHOX2BQ99453 314 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSG101Q99816 390 aa-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-1.18□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AMHP03971 560 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TYMSOSQ8TAI1 123 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCNX1Q96RV3 2341 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SALL3Q9BXA9 1300 aa-1.19□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM42Q8IWZ5 723 aa-1.2□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPRR2DP22532 72 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TCTN1Q2MV58 587 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD320Q9NPF0 282 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BRWD1Q9NSI6 2320 aa-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-1.21□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SHISA7A6NL88 538 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BSPRYQ5W0U4 402 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM117BQ6P1L5 589 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNRF4Q8WWF5 429 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF503Q96F45 646 aa-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-1.22□□□□□ -2.6
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITPR3Q14573 2671 aa-1.22□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCE2BO14633 110 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IL4RP24394 825 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBMXP38159 391 aaKnown RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KDM7AQ6ZMT4 941 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATRXP46100 2492 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TEX15Q9BXT5 2789 aa-1.23□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-1.24□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZIC5Q96T25 663 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TACC2O95359 2948 aa-1.25□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPRR2EP22531 72 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPRR2BP35325 72 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPRR2AP35326 72 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WASP42768 502 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZAR1Q86SH2 424 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSRNP3Q8WYN3 585 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WBP2Q969T9 261 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITGB2P05107 769 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFAND6Q6FIF0 208 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STRN4Q9NRL3 753 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPTBN2O15020 2390 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COBLO75128 1261 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C11orf87Q6NUJ2 197 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RARAP10276 462 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CPOXP36551 454 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP6R1Q9UPN7 881 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CACNA1BQ00975 2339 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL6A6A6NMZ7 2263 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPRNQ4KMQ1 711 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRINAQ7Z429 371 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HCN2Q9UL51 889 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRK2Q5S007 2527 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT38O76015 456 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLITRK3O94933 977 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP12-4P60329 112 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DCAF10Q5QP82 559 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NFATC3Q12968 1075 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT31Q15323 416 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FN1P02751 2386 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CUBNO60494 3623 aa-1.33□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms