RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360476.7

NMB-201, Transcript of neuromedin B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NMB, Length 1,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMB-201ENST00000360476 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.84■■■■■ 4.29
NMB-201ENST00000360476 NWD1Q149M9 1564 aa41.81■■■■■ 4.28
NMB-201ENST00000360476 ZFYVE9O95405 1425 aa41.81■■■■■ 4.28
NMB-201ENST00000360476 ITGAEP38570 1179 aa41.77■■■■■ 4.28
NMB-201ENST00000360476 TMEM94Q12767 1356 aa41.76■■■■■ 4.27
NMB-201ENST00000360476 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.74■■■■■ 4.27
NMB-201ENST00000360476 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
NMB-201ENST00000360476 KCNA6P17658 529 aa41.73■■■■■ 4.27
NMB-201ENST00000360476 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
NMB-201ENST00000360476 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
NMB-201ENST00000360476 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.67■■■■■ 4.26
NMB-201ENST00000360476 BCANQ96GW7 911 aa41.67■■■■■ 4.26
NMB-201ENST00000360476 NUP155O75694 1391 aa41.64■■■■■ 4.26
NMB-201ENST00000360476 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
NMB-201ENST00000360476 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.63■■■■■ 4.25
NMB-201ENST00000360476 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
NMB-201ENST00000360476 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.61■■■■■ 4.25
NMB-201ENST00000360476 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
NMB-201ENST00000360476 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
NMB-201ENST00000360476 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.55■■■■■ 4.24
NMB-201ENST00000360476 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.52■■■■■ 4.24
NMB-201ENST00000360476 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
NMB-201ENST00000360476 DIP2AQ14689 1571 aa41.5■■■■■ 4.23
NMB-201ENST00000360476 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
NMB-201ENST00000360476 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
NMB-201ENST00000360476 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.45■■■■■ 4.23
NMB-201ENST00000360476 MSH6P52701 1360 aa41.45■■■■■ 4.23
NMB-201ENST00000360476 TBX22Q9Y458 520 aa41.43■■■■■ 4.22
NMB-201ENST00000360476 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.43■■■■■ 4.22
NMB-201ENST00000360476 PHLPP1O60346 1717 aa41.4■■■■■ 4.22
NMB-201ENST00000360476 CLTCL1P53675 1640 aa41.4■■■■■ 4.22
NMB-201ENST00000360476 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
NMB-201ENST00000360476 TRPM2O94759 1503 aa41.37■■■■■ 4.21
NMB-201ENST00000360476 NAIPQ13075 1403 aa41.36■■■■■ 4.21
NMB-201ENST00000360476 PTPRUQ92729 1446 aa41.33■■■■■ 4.21
NMB-201ENST00000360476 KIF1BO60333 1816 aa41.3■■■■■ 4.2
NMB-201ENST00000360476 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
NMB-201ENST00000360476 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.3■■■■■ 4.2
NMB-201ENST00000360476 SLAIN2Q9P270 581 aa41.3■■■■■ 4.2
NMB-201ENST00000360476 PIK3R4Q99570 1358 aa41.29■■■■■ 4.2
NMB-201ENST00000360476 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
NMB-201ENST00000360476 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.26■■■■■ 4.19
NMB-201ENST00000360476 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.19
NMB-201ENST00000360476 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.25■■■■■ 4.19
NMB-201ENST00000360476 C14orf37Q86TY3 774 aa41.23■■■■■ 4.19
NMB-201ENST00000360476 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
NMB-201ENST00000360476 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.19■■■■■ 4.18
NMB-201ENST00000360476 HFM1A2PYH4 1435 aa41.16■■■■■ 4.18
NMB-201ENST00000360476 METP08581 1390 aa41.12■■■■■ 4.17
NMB-201ENST00000360476 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
NMB-201ENST00000360476 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.11■■■■■ 4.17
NMB-201ENST00000360476 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
NMB-201ENST00000360476 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.08■■■■■ 4.17
NMB-201ENST00000360476 JCADQ9P266 1359 aa41.08■■■■■ 4.17
NMB-201ENST00000360476 ATF3P18847 181 aa41.07■■■■■ 4.17
NMB-201ENST00000360476 TRIM52Q96A61 297 aa41.07■■■■■ 4.17
NMB-201ENST00000360476 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.07■■■■■ 4.16
NMB-201ENST00000360476 POTEAQ6S8J7 498 aa41.04■■■■■ 4.16
NMB-201ENST00000360476 SHPRHQ149N8 1683 aa41.03■■■■■ 4.16
NMB-201ENST00000360476 PPLO60437 1756 aa41.02■■■■■ 4.16
NMB-201ENST00000360476 DCCP43146 1447 aa41.01■■■■■ 4.15
NMB-201ENST00000360476 LRP6O75581 1613 aa41■■■■■ 4.15
NMB-201ENST00000360476 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.97■■■■■ 4.15
NMB-201ENST00000360476 MST1RQ04912 1400 aa40.96■■■■■ 4.15
NMB-201ENST00000360476 BRINP3Q76B58 766 aa40.96■■■■■ 4.15
NMB-201ENST00000360476 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.95■■■■■ 4.15
NMB-201ENST00000360476 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
NMB-201ENST00000360476 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.93■■■■■ 4.14
NMB-201ENST00000360476 FOXD1Q16676 465 aa40.88■■■■■ 4.13
NMB-201ENST00000360476 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.83■■■■■ 4.13
NMB-201ENST00000360476 PTCH1Q13635 1447 aa40.82■■■■■ 4.12
NMB-201ENST00000360476 IFT172Q9UG01 1749 aa40.81■■■■■ 4.12
NMB-201ENST00000360476 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.8■■■■■ 4.12
NMB-201ENST00000360476 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
NMB-201ENST00000360476 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.75■■■■■ 4.11
NMB-201ENST00000360476 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
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NMB-201ENST00000360476 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.74■■■■■ 4.11
NMB-201ENST00000360476 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.74■■■■■ 4.11
NMB-201ENST00000360476 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.7■■■■■ 4.11
NMB-201ENST00000360476 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.69■■■■■ 4.1
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NMB-201ENST00000360476 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
NMB-201ENST00000360476 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
NMB-201ENST00000360476 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.67■■■■■ 4.1
NMB-201ENST00000360476 LAMC1P11047 1609 aa40.67■■■■■ 4.1
NMB-201ENST00000360476 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.66■■■■■ 4.1
NMB-201ENST00000360476 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.64■■■■■ 4.1
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NMB-201ENST00000360476 RGL3Q3MIN7 710 aa40.6■■■■■ 4.09
NMB-201ENST00000360476 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.57■■■■■ 4.09
NMB-201ENST00000360476 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
NMB-201ENST00000360476 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
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NMB-201ENST00000360476 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa40.56■■■■■ 4.08
NMB-201ENST00000360476 AFF2P51816 1311 aa40.5■■■■■ 4.07
NMB-201ENST00000360476 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.49■■■■■ 4.07
NMB-201ENST00000360476 PIK3C2GO75747 1445 aa40.49■■■■■ 4.07
NMB-201ENST00000360476 STK26Q9P289 416 aa40.47■■■■■ 4.07
NMB-201ENST00000360476 TECPR2O15040 1411 aa40.47■■■■■ 4.07
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