RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353284.7

PTPRS-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-202ENST00000353284 ST18O60284 1047 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-202ENST00000353284 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-202ENST00000353284 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRS-202ENST00000353284 RUNDC1Q96C34 613 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 HMMRO75330 724 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 TCP11L2Q8N4U5 519 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 HMGXB3Q12766 1538 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 MAPKBP1O60336 1514 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 TRAK2O60296 914 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 STK31Q9BXU1 1019 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 NRDCO43847 1150 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 RIPK4P57078 832 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRS-202ENST00000353284 MRE11P49959 708 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 PDE3AQ14432 1141 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 NCOA1Q15788 1441 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 A0A0G2JS52 829 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 MTHFSP49914 203 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 EVC2Q86UK5 1308 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 AAMPQ13685 434 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 RILPL2Q969X0 211 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 PRDM2Q13029 1718 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 GRIN2BQ13224 1484 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 DAPK1P53355 1430 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 MAP3K1Q13233 1512 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 KIF16BQ96L93 1317 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 NUTM2FA1L443 756 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 MCTP1Q6DN14 999 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
PTPRS-202ENST00000353284 PHF14O94880 888 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 REC8O95072 547 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 SLFN5Q08AF3 891 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 NUCB2P80303 420 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 STAC3Q96MF2 364 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 IFT140Q96RY7 1462 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 HMOX1P09601 288 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 MCM4P33991 863 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 TOPBP1Q92547 1522 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 ERBINQ96RT1 1412 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 PTPRKQ15262 1439 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 RNF214Q8ND24 703 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 CABP2Q9NPB3 220 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRS-202ENST00000353284 ROCK1Q13464 1354 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 AFAP1Q8N556 730 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 CDC45O75419 566 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 COG3Q96JB2 828 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 AMPHP49418 695 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 ZMYND15Q9H091 742 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 GNAI1P63096 354 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 WWC1Q8IX03 1113 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRS-202ENST00000353284 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms