RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 COG6Q9Y2V7 657 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 GNAI1P63096 354 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 PLIN1O60240 522 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 CABP2Q9NPB3 220 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 ROCK1Q13464 1354 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 TOMM22Q9NS69 142 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 CRBNQ96SW2 442 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF16BQ96L93 1317 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 CLSTN1O94985 981 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 NLRP6P59044 892 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 RILPL2Q969X0 211 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM161AQ3B820 660 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 HECW1Q76N89 1606 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.14■□□□□ 0.82
SH3BP4-201ENST00000344528 HMOX1P09601 288 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 TPM4P67936 248 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 MTHFSP49914 203 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 AAMPQ13685 434 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 PDE4AP27815 886 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 NECTIN2Q92692 538 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 REC8O95072 547 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 PRAM1Q96QH2 718 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-201ENST00000344528 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.08■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.83e-6■■□□□ 13
SH3BP4-201ENST00000344528 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.08■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 TIAM1Q13009 1591 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 MSH5O43196 834 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 ABTB2Q8N961 1025 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 RAPGEF3O95398 923 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 DAPK1P53355 1430 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 PHF14O94880 888 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP2R1AP30153 589 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 H3BQV1 296 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 IFFO2Q5TF58 517 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4-201ENST00000344528 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.02■□□□□ 0.8
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