RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328739.5

VMO1-201, Transcript of vitelline membrane outer layer 1 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMO1, Length 766 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMO1-201ENST00000328739 ZFYVE9O95405 1425 aa28.79■■■□□ 2.2
VMO1-201ENST00000328739 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.78■■■□□ 2.2
VMO1-201ENST00000328739 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
VMO1-201ENST00000328739 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.77■■■□□ 2.2
VMO1-201ENST00000328739 KIF1BO60333 1816 aa28.77■■■□□ 2.2
VMO1-201ENST00000328739 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.77■■■□□ 2.2
VMO1-201ENST00000328739 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
VMO1-201ENST00000328739 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
VMO1-201ENST00000328739 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
VMO1-201ENST00000328739 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.75■■■□□ 2.19
VMO1-201ENST00000328739 MED14O60244 1454 aa28.72■■■□□ 2.19
VMO1-201ENST00000328739 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
VMO1-201ENST00000328739 BCANQ96GW7 911 aa28.71■■■□□ 2.19
VMO1-201ENST00000328739 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.69■■■□□ 2.18
VMO1-201ENST00000328739 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.69■■■□□ 2.18
VMO1-201ENST00000328739 NEUROD1Q13562 356 aa28.68■■■□□ 2.18
VMO1-201ENST00000328739 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.66■■■□□ 2.18
VMO1-201ENST00000328739 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.66■■■□□ 2.18
VMO1-201ENST00000328739 IQGAP1P46940 1657 aa28.64■■■□□ 2.17
VMO1-201ENST00000328739 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
VMO1-201ENST00000328739 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.61■■■□□ 2.17
VMO1-201ENST00000328739 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.59■■■□□ 2.17
VMO1-201ENST00000328739 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
VMO1-201ENST00000328739 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.58■■■□□ 2.17
VMO1-201ENST00000328739 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.57■■■□□ 2.16
VMO1-201ENST00000328739 PPLO60437 1756 aa28.57■■■□□ 2.16
VMO1-201ENST00000328739 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
VMO1-201ENST00000328739 TBX22Q9Y458 520 aa28.53■■■□□ 2.16
VMO1-201ENST00000328739 IFT172Q9UG01 1749 aa28.52■■■□□ 2.16
VMO1-201ENST00000328739 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.51■■■□□ 2.15
VMO1-201ENST00000328739 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.51■■■□□ 2.15
VMO1-201ENST00000328739 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.5■■■□□ 2.15
VMO1-201ENST00000328739 MYOM2P54296 1465 aa28.48■■■□□ 2.15
VMO1-201ENST00000328739 METP08581 1390 aa28.45■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.45■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 PIK3C2GO75747 1445 aa28.44■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 KCNA6P17658 529 aa28.44■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.43■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.43■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 ALKQ9UM73 1620 aa28.43■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.43■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 DIP2AQ14689 1571 aa28.42■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 TONSLQ96HA7 1378 aa28.41■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 STAC3Q96MF2 364 aa28.41■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 PTPRUQ92729 1446 aa28.41■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
VMO1-201ENST00000328739 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.38■■■□□ 2.13
VMO1-201ENST00000328739 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.38■■■□□ 2.13
VMO1-201ENST00000328739 PIK3R4Q99570 1358 aa28.37■■■□□ 2.13
VMO1-201ENST00000328739 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.37■■■□□ 2.13
VMO1-201ENST00000328739 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
VMO1-201ENST00000328739 CERKQ8TCT0 537 aa28.34■■■□□ 2.13
VMO1-201ENST00000328739 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
VMO1-201ENST00000328739 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.33■■■□□ 2.13
VMO1-201ENST00000328739 CPS1P31327 1500 aa28.33■■■□□ 2.13
VMO1-201ENST00000328739 NWD1Q149M9 1564 aa28.32■■■□□ 2.12
VMO1-201ENST00000328739 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
VMO1-201ENST00000328739 STK26Q9P289 416 aa28.31■■■□□ 2.12
VMO1-201ENST00000328739 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.31■■■□□ 2.12
VMO1-201ENST00000328739 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
VMO1-201ENST00000328739 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.3■■■□□ 2.12
VMO1-201ENST00000328739 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.29■■■□□ 2.12
VMO1-201ENST00000328739 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.26■■■□□ 2.11
VMO1-201ENST00000328739 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
VMO1-201ENST00000328739 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
VMO1-201ENST00000328739 TMEM94Q12767 1356 aa28.25■■■□□ 2.11
VMO1-201ENST00000328739 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
VMO1-201ENST00000328739 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
VMO1-201ENST00000328739 LAMC1P11047 1609 aa28.23■■■□□ 2.11
VMO1-201ENST00000328739 ADGRB1O14514 1584 aa28.22■■■□□ 2.11
VMO1-201ENST00000328739 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.22■■■□□ 2.11
VMO1-201ENST00000328739 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
VMO1-201ENST00000328739 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.2■■■□□ 2.1
VMO1-201ENST00000328739 ABCC11Q96J66 1382 aa28.2■■■□□ 2.1
VMO1-201ENST00000328739 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.19■■■□□ 2.1
VMO1-201ENST00000328739 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.17■■■□□ 2.1
VMO1-201ENST00000328739 C14orf37Q86TY3 774 aa28.16■■■□□ 2.1
VMO1-201ENST00000328739 PTCH1Q13635 1447 aa28.16■■■□□ 2.1
VMO1-201ENST00000328739 TECPR2O15040 1411 aa28.15■■■□□ 2.1
VMO1-201ENST00000328739 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.14■■■□□ 2.1
VMO1-201ENST00000328739 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.13■■■□□ 2.09
VMO1-201ENST00000328739 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.13■■■□□ 2.09
VMO1-201ENST00000328739 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
VMO1-201ENST00000328739 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
VMO1-201ENST00000328739 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.11■■■□□ 2.09
VMO1-201ENST00000328739 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
VMO1-201ENST00000328739 SIRT1Q96EB6 747 aa28.1■■■□□ 2.09
VMO1-201ENST00000328739 PRAM1Q96QH2 718 aa28.1■■■□□ 2.09
VMO1-201ENST00000328739 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.09■■■□□ 2.09
VMO1-201ENST00000328739 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.09■■■□□ 2.09
VMO1-201ENST00000328739 POGKQ9P215 609 aa28.08■■■□□ 2.09
VMO1-201ENST00000328739 MSH6P52701 1360 aa28.08■■■□□ 2.09
VMO1-201ENST00000328739 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.07■■■□□ 2.08
VMO1-201ENST00000328739 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.06■■■□□ 2.08
VMO1-201ENST00000328739 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.06■■■□□ 2.08
VMO1-201ENST00000328739 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.06■■■□□ 2.08
VMO1-201ENST00000328739 DLC1Q96QB1 1528 aa28.05■■■□□ 2.08
VMO1-201ENST00000328739 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.05■■■□□ 2.08
VMO1-201ENST00000328739 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.03■■■□□ 2.08
VMO1-201ENST00000328739 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms