RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 MED14O60244 1454 aa29.57■■■□□ 2.32
RAB11B-201ENST00000328024 EID1Q9Y6B2 187 aa29.56■■■□□ 2.32
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
RAB11B-201ENST00000328024 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.55■■■□□ 2.32
RAB11B-201ENST00000328024 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.55■■■□□ 2.32
RAB11B-201ENST00000328024 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
RAB11B-201ENST00000328024 RGL3Q3MIN7 710 aa29.5■■■□□ 2.31
RAB11B-201ENST00000328024 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
RAB11B-201ENST00000328024 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.5■■■□□ 2.31
RAB11B-201ENST00000328024 IQGAP1P46940 1657 aa29.49■■■□□ 2.31
RAB11B-201ENST00000328024 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
RAB11B-201ENST00000328024 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
RAB11B-201ENST00000328024 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
RAB11B-201ENST00000328024 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.44■■■□□ 2.3
RAB11B-201ENST00000328024 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.43■■■□□ 2.3
RAB11B-201ENST00000328024 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.43■■■□□ 2.3
RAB11B-201ENST00000328024 PPLO60437 1756 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB11B-201ENST00000328024 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.41■■■□□ 2.3
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
RAB11B-201ENST00000328024 BCANQ96GW7 911 aa29.37■■■□□ 2.29
RAB11B-201ENST00000328024 IFT172Q9UG01 1749 aa29.37■■■□□ 2.29
RAB11B-201ENST00000328024 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.36■■■□□ 2.29
RAB11B-201ENST00000328024 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.36■■■□□ 2.29
RAB11B-201ENST00000328024 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
RAB11B-201ENST00000328024 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.35■■■□□ 2.29
RAB11B-201ENST00000328024 NEUROD1Q13562 356 aa29.32■■■□□ 2.28
RAB11B-201ENST00000328024 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.31■■■□□ 2.28
RAB11B-201ENST00000328024 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.3■■■□□ 2.28
RAB11B-201ENST00000328024 TBX22Q9Y458 520 aa29.3■■■□□ 2.28
RAB11B-201ENST00000328024 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.28■■■□□ 2.28
RAB11B-201ENST00000328024 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.27■■■□□ 2.28
RAB11B-201ENST00000328024 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.26■■■□□ 2.27
RAB11B-201ENST00000328024 MYOM2P54296 1465 aa29.25■■■□□ 2.27
RAB11B-201ENST00000328024 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.24■■■□□ 2.27
RAB11B-201ENST00000328024 DIP2AQ14689 1571 aa29.23■■■□□ 2.27
RAB11B-201ENST00000328024 METP08581 1390 aa29.22■■■□□ 2.27
RAB11B-201ENST00000328024 PIK3C2GO75747 1445 aa29.22■■■□□ 2.27
RAB11B-201ENST00000328024 ALKQ9UM73 1620 aa29.22■■■□□ 2.27
RAB11B-201ENST00000328024 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.21■■■□□ 2.27
RAB11B-201ENST00000328024 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
RAB11B-201ENST00000328024 KCNA6P17658 529 aa29.2■■■□□ 2.26
RAB11B-201ENST00000328024 PTPRUQ92729 1446 aa29.2■■■□□ 2.26
RAB11B-201ENST00000328024 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
RAB11B-201ENST00000328024 PIK3R4Q99570 1358 aa29.15■■■□□ 2.26
RAB11B-201ENST00000328024 NWD1Q149M9 1564 aa29.15■■■□□ 2.26
RAB11B-201ENST00000328024 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.15■■■□□ 2.26
RAB11B-201ENST00000328024 CERKQ8TCT0 537 aa29.15■■■□□ 2.26
RAB11B-201ENST00000328024 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
RAB11B-201ENST00000328024 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
RAB11B-201ENST00000328024 CPS1P31327 1500 aa29.14■■■□□ 2.26
RAB11B-201ENST00000328024 STAC3Q96MF2 364 aa29.13■■■□□ 2.25
RAB11B-201ENST00000328024 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.12■■■□□ 2.25
RAB11B-201ENST00000328024 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.11■■■□□ 2.25
RAB11B-201ENST00000328024 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.11■■■□□ 2.25
RAB11B-201ENST00000328024 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.1■■■□□ 2.25
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.1■■■□□ 2.25
RAB11B-201ENST00000328024 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
RAB11B-201ENST00000328024 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
RAB11B-201ENST00000328024 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.06■■■□□ 2.24
RAB11B-201ENST00000328024 TONSLQ96HA7 1378 aa29.05■■■□□ 2.24
RAB11B-201ENST00000328024 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
RAB11B-201ENST00000328024 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
RAB11B-201ENST00000328024 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM94Q12767 1356 aa29.03■■■□□ 2.24
RAB11B-201ENST00000328024 LAMC1P11047 1609 aa29.03■■■□□ 2.24
RAB11B-201ENST00000328024 ADGRB1O14514 1584 aa29.01■■■□□ 2.23
RAB11B-201ENST00000328024 NBPF8Q3BBV2 869 aa29■■■□□ 2.23
RAB11B-201ENST00000328024 STK26Q9P289 416 aa29■■■□□ 2.23
RAB11B-201ENST00000328024 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
RAB11B-201ENST00000328024 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
RAB11B-201ENST00000328024 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.98■■■□□ 2.23
RAB11B-201ENST00000328024 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
RAB11B-201ENST00000328024 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.97■■■□□ 2.23
RAB11B-201ENST00000328024 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.97■■■□□ 2.23
RAB11B-201ENST00000328024 ABCC11Q96J66 1382 aa28.95■■■□□ 2.22
RAB11B-201ENST00000328024 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.94■■■□□ 2.22
RAB11B-201ENST00000328024 TECPR2O15040 1411 aa28.93■■■□□ 2.22
RAB11B-201ENST00000328024 PTCH1Q13635 1447 aa28.93■■■□□ 2.22
RAB11B-201ENST00000328024 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.9■■■□□ 2.22
RAB11B-201ENST00000328024 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.9■■■□□ 2.22
RAB11B-201ENST00000328024 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.89■■■□□ 2.22
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RAB11B-201ENST00000328024 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.88■■■□□ 2.21
RAB11B-201ENST00000328024 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.88■■■□□ 2.21
RAB11B-201ENST00000328024 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.88■■■□□ 2.21
RAB11B-201ENST00000328024 SIRT1Q96EB6 747 aa28.85■■■□□ 2.21
RAB11B-201ENST00000328024 C14orf37Q86TY3 774 aa28.84■■■□□ 2.21
RAB11B-201ENST00000328024 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.83■■■□□ 2.21
RAB11B-201ENST00000328024 DLC1Q96QB1 1528 aa28.82■■■□□ 2.2
RAB11B-201ENST00000328024 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.82■■■□□ 2.2
RAB11B-201ENST00000328024 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.82■■■□□ 2.2
RAB11B-201ENST00000328024 MSH6P52701 1360 aa28.81■■■□□ 2.2
RAB11B-201ENST00000328024 PRAM1Q96QH2 718 aa28.81■■■□□ 2.2
RAB11B-201ENST00000328024 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.81■■■□□ 2.2
RAB11B-201ENST00000328024 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
RAB11B-201ENST00000328024 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.8■■■□□ 2.2
RAB11B-201ENST00000328024 FBXO41Q8TF61 875 aa28.8■■■□□ 2.2
RAB11B-201ENST00000328024 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
RAB11B-201ENST00000328024 TOM1O60784 492 aa28.78■■■□□ 2.2
RAB11B-201ENST00000328024 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
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