RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299687.9

ZNF407-201, Transcript of zinc finger protein 407, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF407, Length 7,948 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407-201ENST00000299687 OFD1O75665 1012 aa14.89□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 19.3
ZNF407-201ENST00000299687 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.89□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.89□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 NEFHP12036 1026 aa14.88□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.88□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.88□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.87□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.86□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 RNF20Q5VTR2 975 aa14.86□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.86□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 NGEFQ8N5V2 710 aa14.86□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 CAGE1Q8TC20 777 aa14.85□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.85□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 BICD2Q8TD16 824 aa14.85□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 PKD2Q13563 968 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 MNS1Q8NEH6 495 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 XBP1P17861 261 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.84□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 SASS6Q6UVJ0 657 aa14.83□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
ZNF407-201ENST00000299687 COG3Q96JB2 828 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 NUTM2FA1L443 756 aa14.83□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 CCER2I3L3R5 266 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.82□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 ANKRD62A6NC57 917 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 SYCP1Q15431 976 aa14.81□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 PSME1Q06323 249 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 ROCK1Q13464 1354 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 UACAQ9BZF9 1416 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 KIF3BO15066 747 aa14.8□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 REC8O95072 547 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 NUP155O75694 1391 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 CCDC27Q2M243 656 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 IFT57Q9NWB7 429 aa14.79□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 OLFM4Q6UX06 510 aa14.78□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.77□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.77□□□□□ -0.04
ZNF407-201ENST00000299687 PDILTQ8N807 584 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.77□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 ERLIN2O94905 339 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.76□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 FYB1O15117 783 aa14.75□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.75□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 ATF3P18847 181 aa14.74□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.74□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 FOSBP53539 338 aa14.74□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 DESP17661 470 aa14.74□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.74□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.74□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa14.73□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.72□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 EVC2Q86UK5 1308 aa14.72□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 ERC2O15083 957 aa14.72□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.72□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 TXLNAP40222 546 aa14.72□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.71□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 PDE3BQ13370 1112 aa14.71□□□□□ -0.05
ZNF407-201ENST00000299687 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.71□□□□□ -0.06
ZNF407-201ENST00000299687 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.71□□□□□ -0.06
ZNF407-201ENST00000299687 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ZNF407-201ENST00000299687 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ZNF407-201ENST00000299687 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms