RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 DAPK1P53355 1430 aa25.38■■□□□ 1.65
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CLEC1B-201ENST00000298527 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.36■■□□□ 1.65
CLEC1B-201ENST00000298527 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.34■■□□□ 1.65
CLEC1B-201ENST00000298527 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.34■■□□□ 1.65
CLEC1B-201ENST00000298527 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CLEC1B-201ENST00000298527 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.33■■□□□ 1.65
CLEC1B-201ENST00000298527 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.32■■□□□ 1.64
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CLEC1B-201ENST00000298527 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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CLEC1B-201ENST00000298527 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.29■■□□□ 1.64
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CLEC1B-201ENST00000298527 C14orf37Q86TY3 774 aa25.24■■□□□ 1.63
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CLEC1B-201ENST00000298527 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
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CLEC1B-201ENST00000298527 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.22■■□□□ 1.63
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CLEC1B-201ENST00000298527 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.2■■□□□ 1.62
CLEC1B-201ENST00000298527 ADGRL2O95490 1459 aa25.2■■□□□ 1.62
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CLEC1B-201ENST00000298527 PIK3R4Q99570 1358 aa25.18■■□□□ 1.62
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CLEC1B-201ENST00000298527 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CLEC1B-201ENST00000298527 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CLEC1B-201ENST00000298527 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.15■■□□□ 1.62
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CLEC1B-201ENST00000298527 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CLEC1B-201ENST00000298527 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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CLEC1B-201ENST00000298527 C8orf37Q96NL8 207 aa24.95■■□□□ 1.58
CLEC1B-201ENST00000298527 RGS12O14924 1447 aa24.95■■□□□ 1.58
CLEC1B-201ENST00000298527 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
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CLEC1B-201ENST00000298527 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.91■■□□□ 1.58
CLEC1B-201ENST00000298527 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.91■■□□□ 1.58
CLEC1B-201ENST00000298527 NGLY1Q96IV0 654 aa24.9■■□□□ 1.58
CLEC1B-201ENST00000298527 ROCK1Q13464 1354 aa24.89■■□□□ 1.57
CLEC1B-201ENST00000298527 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.88■■□□□ 1.57
CLEC1B-201ENST00000298527 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.88■■□□□ 1.57
CLEC1B-201ENST00000298527 NUP155O75694 1391 aa24.86■■□□□ 1.57
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CLEC1B-201ENST00000298527 METP08581 1390 aa24.85■■□□□ 1.57
CLEC1B-201ENST00000298527 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.85■■□□□ 1.57
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CLEC1B-201ENST00000298527 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.79■■□□□ 1.56
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CLEC1B-201ENST00000298527 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CLEC1B-201ENST00000298527 PTCH1Q13635 1447 aa24.75■■□□□ 1.55
CLEC1B-201ENST00000298527 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CLEC1B-201ENST00000298527 CCDC125Q86Z20 511 aa24.71■■□□□ 1.55
CLEC1B-201ENST00000298527 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.71■■□□□ 1.55
CLEC1B-201ENST00000298527 ATRNO75882 1429 aa24.7■■□□□ 1.55
CLEC1B-201ENST00000298527 ORAI2Q96SN7 254 aa24.69■■□□□ 1.54
CLEC1B-201ENST00000298527 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
CLEC1B-201ENST00000298527 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.64■■□□□ 1.54
CLEC1B-201ENST00000298527 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.64■■□□□ 1.53
CLEC1B-201ENST00000298527 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CLEC1B-201ENST00000298527 CLTCL1P53675 1640 aa24.63■■□□□ 1.53
CLEC1B-201ENST00000298527 KIF1BO60333 1816 aa24.62■■□□□ 1.53
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