RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 BECN2A8MW95 431 aa25.92■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 RIPK4P57078 832 aa25.92■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 IGF1RP08069 1367 aa25.91■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.91■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 CUX1P39880 1505 aa25.9■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 MIA2Q96PC5 1412 aa25.9■■□□□ 1.74
CCSAP-201ENST00000284617 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 CREBRFQ8IUR6 639 aa25.88■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 GNAI1P63096 354 aa25.84■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 NUCB2P80303 420 aa25.84■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CCSAP-201ENST00000284617 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.82■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 MARCH6O60337 910 aa25.81■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 RNF20Q5VTR2 975 aa25.81■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 TPM1P09493 284 aa25.81■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.8■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 MCTP1Q6DN14 999 aa25.8■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.8■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.79■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.79■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 ANO2Q9NQ90 1003 aa25.79■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 G3V3G9 751 aa25.79■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.79■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.78■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 KIF21BO75037 1637 aa25.78■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.78■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 CEP89Q96ST8 783 aa25.77■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.77■■□□□ 1.72
CCSAP-201ENST00000284617 PES1O00541 588 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.75■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 LNPKQ9C0E8 428 aa25.75■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM29Q14134 588 aa25.75■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 TPM2P07951 284 aa25.73■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 CPLX1O14810 134 aa25.73■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.73■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 GPS2Q13227 327 aa25.71■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.71■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 BICD2Q8TD16 824 aa25.71■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.71■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 ERC2O15083 957 aa25.71■■□□□ 1.71
CCSAP-201ENST00000284617 PANK1Q8TE04 598 aa25.7■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 NFKBIBQ15653 356 aa25.7■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 CDC45O75419 566 aa25.69■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.69■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.69■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 TRDNQ13061 729 aa25.68■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC70Q6NSX1 233 aa25.68■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 NCOA2Q15596 1464 aa25.68■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.66■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 NECTIN2Q92692 538 aa25.66■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 VPS53Q5VIR6 699 aa25.66■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.64■■□□□ 1.7
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 MRE11P49959 708 aa25.64■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.64■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF592Q92610 1267 aa25.64■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.64■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.63■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 APPP05067 770 aa25.62■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 HMOX1P09601 288 aa25.62■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 EVA1CP58658 441 aa25.62■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.62■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.61■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 MTHFSP49914 203 aa25.6■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.6■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 PSME1Q06323 249 aa25.59■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 PDE3AQ14432 1141 aa25.59■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 PPP2R1AP30153 589 aa25.59■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 PDE4CQ08493 712 aa25.58■■□□□ 1.69
CCSAP-201ENST00000284617 HOMER1Q86YM7 354 aa25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms