RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
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USP12-201ENST00000282344 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.98■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 TOPBP1Q92547 1522 aa26.98■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.97■■□□□ 1.91
USP12-201ENST00000282344 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
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USP12-201ENST00000282344 DAPK1P53355 1430 aa26.94■■□□□ 1.9
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USP12-201ENST00000282344 SKAP1Q86WV1 359 aa26.93■■□□□ 1.9
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USP12-201ENST00000282344 RILPL2Q969X0 211 aa26.93■■□□□ 1.9
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USP12-201ENST00000282344 CABP2Q9NPB3 220 aa26.89■■□□□ 1.9
USP12-201ENST00000282344 HMOX1P09601 288 aa26.89■■□□□ 1.89
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USP12-201ENST00000282344 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.87■■□□□ 1.89
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USP12-201ENST00000282344 KIF16BQ96L93 1317 aa26.86■■□□□ 1.89
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USP12-201ENST00000282344 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
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USP12-201ENST00000282344 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
USP12-201ENST00000282344 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.8■■□□□ 1.88
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USP12-201ENST00000282344 REC8O95072 547 aa26.78■■□□□ 1.88
USP12-201ENST00000282344 NCOA1Q15788 1441 aa26.78■■□□□ 1.88
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USP12-201ENST00000282344 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.77■■□□□ 1.88
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USP12-201ENST00000282344 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.75■■□□□ 1.87
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USP12-201ENST00000282344 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.71■■□□□ 1.87
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USP12-201ENST00000282344 ABCC5O15440 1437 aa26.71■■□□□ 1.87
USP12-201ENST00000282344 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
USP12-201ENST00000282344 EID1Q9Y6B2 187 aa26.7■■□□□ 1.87
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USP12-201ENST00000282344 MCTP1Q6DN14 999 aa26.69■■□□□ 1.86
USP12-201ENST00000282344 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.69■■□□□ 1.86
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USP12-201ENST00000282344 WWC1Q8IX03 1113 aa26.63■■□□□ 1.85
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USP12-201ENST00000282344 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.62■■□□□ 1.85
USP12-201ENST00000282344 TEFQ10587 303 aa26.61■■□□□ 1.85
USP12-201ENST00000282344 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.6■■□□□ 1.85
USP12-201ENST00000282344 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
USP12-201ENST00000282344 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.6■■□□□ 1.85
USP12-201ENST00000282344 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
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