RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
FAM53B-201	ENST00000280780	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FAM53B-201	ENST00000280780	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
FAM53B-201	ENST00000280780	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.52	■■■□□ 2.8
FAM53B-201	ENST00000280780	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
FAM53B-201	ENST00000280780	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.52	■■■□□ 2.8
FAM53B-201	ENST00000280780	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
FAM53B-201	ENST00000280780	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FAM53B-201	ENST00000280780	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FAM53B-201	ENST00000280780	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FAM53B-201	ENST00000280780	KIF1B	O60333	1816 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FAM53B-201	ENST00000280780	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
FAM53B-201	ENST00000280780	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.4	■■■□□ 2.78
FAM53B-201	ENST00000280780	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FAM53B-201	ENST00000280780	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
FAM53B-201	ENST00000280780	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.36	■■■□□ 2.77
FAM53B-201	ENST00000280780	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
FAM53B-201	ENST00000280780	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FAM53B-201	ENST00000280780	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FAM53B-201	ENST00000280780	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM53B-201	ENST00000280780	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.32	■■■□□ 2.77
FAM53B-201	ENST00000280780	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FAM53B-201	ENST00000280780	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FAM53B-201	ENST00000280780	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FAM53B-201	ENST00000280780	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FAM53B-201	ENST00000280780	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FAM53B-201	ENST00000280780	PPL	O60437	1756 aa		32.23	■■■□□ 2.75
FAM53B-201	ENST00000280780	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.22	■■■□□ 2.75
FAM53B-201	ENST00000280780	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FAM53B-201	ENST00000280780	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FAM53B-201	ENST00000280780	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FAM53B-201	ENST00000280780	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FAM53B-201	ENST00000280780	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
FAM53B-201	ENST00000280780	KCNA6	P17658	529 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FAM53B-201	ENST00000280780	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FAM53B-201	ENST00000280780	CPS1	P31327	1500 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FAM53B-201	ENST00000280780	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.14	■■■□□ 2.73
FAM53B-201	ENST00000280780	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.73
FAM53B-201	ENST00000280780	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
FAM53B-201	ENST00000280780	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FAM53B-201	ENST00000280780	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
FAM53B-201	ENST00000280780	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FAM53B-201	ENST00000280780	MET	P08581	1390 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FAM53B-201	ENST00000280780	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FAM53B-201	ENST00000280780	MYOM2	P54296	1465 aa		32.09	■■■□□ 2.73
FAM53B-201	ENST00000280780	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FAM53B-201	ENST00000280780	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FAM53B-201	ENST00000280780	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
FAM53B-201	ENST00000280780	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.07	■■■□□ 2.72
FAM53B-201	ENST00000280780	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.06	■■■□□ 2.72
FAM53B-201	ENST00000280780	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FAM53B-201	ENST00000280780	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FAM53B-201	ENST00000280780	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
FAM53B-201	ENST00000280780	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.04	■■■□□ 2.72
FAM53B-201	ENST00000280780	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.03	■■■□□ 2.72
FAM53B-201	ENST00000280780	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FAM53B-201	ENST00000280780	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
FAM53B-201	ENST00000280780	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM94	Q12767	1356 aa		32	■■■□□ 2.71
FAM53B-201	ENST00000280780	PIK3C2G	O75747	1445 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FAM53B-201	ENST00000280780	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		31.97	■■■□□ 2.71
FAM53B-201	ENST00000280780	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		31.96	■■■□□ 2.71
FAM53B-201	ENST00000280780	STAC3	Q96MF2	364 aa		31.96	■■■□□ 2.71
FAM53B-201	ENST00000280780	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
FAM53B-201	ENST00000280780	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		31.93	■■■□□ 2.7
FAM53B-201	ENST00000280780	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		31.93	■■■□□ 2.7
FAM53B-201	ENST00000280780	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
FAM53B-201	ENST00000280780	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		31.91	■■■□□ 2.7
FAM53B-201	ENST00000280780	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
FAM53B-201	ENST00000280780	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.89	■■■□□ 2.7
FAM53B-201	ENST00000280780	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		31.88	■■■□□ 2.69
FAM53B-201	ENST00000280780	LAMC1	P11047	1609 aa		31.85	■■■□□ 2.69
FAM53B-201	ENST00000280780	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FAM53B-201	ENST00000280780	TOM1	O60784	492 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FAM53B-201	ENST00000280780	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FAM53B-201	ENST00000280780	STK26	Q9P289	416 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FAM53B-201	ENST00000280780	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FAM53B-201	ENST00000280780	ADGRB1	O14514	1584 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FAM53B-201	ENST00000280780	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FAM53B-201	ENST00000280780	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.76	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	C14orf37	Q86TY3	774 aa		31.76	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	MSH6	P52701	1360 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	ABCC11	Q96J66	1382 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		31.7	■■■□□ 2.67
FAM53B-201	ENST00000280780	TECPR2	O15040	1411 aa		31.7	■■■□□ 2.66
FAM53B-201	ENST00000280780	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.68	■■■□□ 2.66
FAM53B-201	ENST00000280780	SLAIN2	Q9P270	581 aa		31.67	■■■□□ 2.66
FAM53B-201	ENST00000280780	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		31.66	■■■□□ 2.66
FAM53B-201	ENST00000280780	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.65	■■■□□ 2.66

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