RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280245.8

CCDC83-201, Transcript of coiled-coil domain containing 83, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene CCDC83, Length 2,358 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83-201ENST00000280245 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.33■■□□□ 1.17
CCDC83-201ENST00000280245 IFT172Q9UG01 1749 aa22.33■■□□□ 1.17
CCDC83-201ENST00000280245 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.33■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.33■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.32■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 ABCC3O15438 1527 aa22.32■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 ADGRB3O60242 1522 aa22.3■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.29■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 GLI2P10070 1586 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 NOS1P29475 1434 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CCDC83-201ENST00000280245 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.27■■□□□ 1.15
CCDC83-201ENST00000280245 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC83-201ENST00000280245 NLRP13Q86W25 1043 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC83-201ENST00000280245 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CCDC83-201ENST00000280245 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC83-201ENST00000280245 DIP2BQ9P265 1576 aa22.22■■□□□ 1.15
CCDC83-201ENST00000280245 PPLO60437 1756 aa22.21■■□□□ 1.15
CCDC83-201ENST00000280245 CDCA8Q53HL2 280 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 SYNMO15061 1565 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 MYOM1P52179 1685 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 PIK3C2GO75747 1445 aa22.18■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 PIK3C2BO00750 1634 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 TSPOAP1O95153 1857 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 ERVK-7P63135 1459 aa22.16■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.15■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.14■■□□□ 1.14
CCDC83-201ENST00000280245 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 NUDCQ9Y266 331 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 ADGRB1O14514 1584 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 IDI1Q13907 227 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CCDC83-201ENST00000280245 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.08■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 SLC24A1O60721 1099 aa22.07■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 PPP2R1AP30153 589 aa22.06■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.05■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.04■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.03■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.02■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CCDC83-201ENST00000280245 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.01■■□□□ 1.11
CCDC83-201ENST00000280245 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.01■■□□□ 1.11
CCDC83-201ENST00000280245 PPP4R2Q9NY27 417 aa22■■□□□ 1.11
CCDC83-201ENST00000280245 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CCDC83-201ENST00000280245 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.99■■□□□ 1.11
CCDC83-201ENST00000280245 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.99■■□□□ 1.11
CCDC83-201ENST00000280245 INSRP06213 1382 aa21.99■■□□□ 1.11
CCDC83-201ENST00000280245 REREQ9P2R6 1566 aa21.98■■□□□ 1.11
CCDC83-201ENST00000280245 ZFYVE9O95405 1425 aa21.96■■□□□ 1.11
CCDC83-201ENST00000280245 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
CCDC83-201ENST00000280245 AGLP35573 1532 aa21.95■■□□□ 1.1
CCDC83-201ENST00000280245 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.95■■□□□ 1.1
CCDC83-201ENST00000280245 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.94■■□□□ 1.1
CCDC83-201ENST00000280245 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.94■■□□□ 1.1
CCDC83-201ENST00000280245 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.93■■□□□ 1.1
CCDC83-201ENST00000280245 PDE3BQ13370 1112 aa21.92■■□□□ 1.1
CCDC83-201ENST00000280245 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CCDC83-201ENST00000280245 MLECQ14165 292 aa21.91■■□□□ 1.1
CCDC83-201ENST00000280245 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
CCDC83-201ENST00000280245 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.9■■□□□ 1.1
CCDC83-201ENST00000280245 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.89■■□□□ 1.09
CCDC83-201ENST00000280245 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
CCDC83-201ENST00000280245 STK26Q9P289 416 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC83-201ENST00000280245 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.88■■□□□ 1.09
CCDC83-201ENST00000280245 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC83-201ENST00000280245 EVC2Q86UK5 1308 aa21.86■■□□□ 1.09
CCDC83-201ENST00000280245 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC83-201ENST00000280245 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.85■■□□□ 1.09
CCDC83-201ENST00000280245 CABP2Q9NPB3 220 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC83-201ENST00000280245 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.84■■□□□ 1.09
CCDC83-201ENST00000280245 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.83■■□□□ 1.09
CCDC83-201ENST00000280245 PTPRMP28827 1452 aa21.82■■□□□ 1.08
CCDC83-201ENST00000280245 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CCDC83-201ENST00000280245 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CCDC83-201ENST00000280245 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
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