RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268070.8

ADAMTS17-201, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ADAMTS17, Length 6,207 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS17-201ENST00000268070 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.27■■□□□ 1.16
ADAMTS17-201ENST00000268070 USP47Q96K76 1375 aa22.27■■□□□ 1.16
ADAMTS17-201ENST00000268070 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
ADAMTS17-201ENST00000268070 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.27■■□□□ 1.16
ADAMTS17-201ENST00000268070 EVC2Q86UK5 1308 aa22.26■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 NECTIN2Q92692 538 aa22.25■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 APAF1O14727 1248 aa22.24■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.24■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.24■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 TRIM29Q14134 588 aa22.24■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 REC8O95072 547 aa22.23■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.23■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 TEFQ10587 303 aa22.22■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 GPS2Q13227 327 aa22.22■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 RAD21O60216 631 aa22.22■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 WWC1Q8IX03 1113 aa22.21■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.21■■□□□ 1.15
ADAMTS17-201ENST00000268070 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.2■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 BICD2Q8TD16 824 aa22.2■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 WIZO95785 1651 aa22.2■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 FBXW7Q969H0 707 aa22.19■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.19■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 APPP05067 770 aa22.18■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 FOSBP53539 338 aa22.18■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.18■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 RIPK4P57078 832 aa22.17■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 EVA1CP58658 441 aa22.17■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.17■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 CPLX1O14810 134 aa22.16■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.16■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 ROCK1Q13464 1354 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 HOMER1Q86YM7 354 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ADAMTS17-201ENST00000268070 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 RNF20Q5VTR2 975 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.12■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.1■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 MSH5O43196 834 aa22.09■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 TRDNQ13061 729 aa22.09■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 TEX35Q5T0J7 233 aa22.08■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 RUNDC1Q96C34 613 aa22.08■■□□□ 1.13
ADAMTS17-201ENST00000268070 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 VPS37DQ86XT2 251 aa22.08■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 LNPKQ9C0E8 428 aa22.07■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 ERICH2A1L162 156 aa22.06■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 JPH4Q96JJ6 628 aa22.06■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 FBXO3Q9UK99 471 aa22.06■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.05■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 NUCB2P80303 420 aa22.05■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 IFT57Q9NWB7 429 aa22.05■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.05■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.03■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 HMOX1P09601 288 aa22.02■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 PANK1Q8TE04 598 aa22.02■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.02■■□□□ 1.12
ADAMTS17-201ENST00000268070 ERC2O15083 957 aa22.01■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 GNAI1P63096 354 aa22■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 MNS1Q8NEH6 495 aa21.99■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 RUFY1Q96T51 708 aa21.99■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 CDC45O75419 566 aa21.99■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 PSME1Q06323 249 aa21.98■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.98■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 NFKBIBQ15653 356 aa21.97■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 CCDC7Q96M83 1385 aa21.97■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.97■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 FYB1O15117 783 aa21.97■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 KDM4AO75164 1064 aa21.96■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 AK7Q96M32 723 aa21.96■■□□□ 1.11
ADAMTS17-201ENST00000268070 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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