RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258111.4

KCNMB4-201, Transcript of potassium calcium-activated channel subfamily M regulatory beta subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNMB4, Length 4,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4-201ENST00000258111 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.21■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 APAF1O14727 1248 aa25.21■■□□□ 1.63
KCNMB4-201ENST00000258111 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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KCNMB4-201ENST00000258111 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.2■■□□□ 1.62
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KCNMB4-201ENST00000258111 WDR97A6NE52 1622 aa25.19■■□□□ 1.62
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KCNMB4-201ENST00000258111 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.19■■□□□ 1.62
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KCNMB4-201ENST00000258111 CUL7Q14999 1698 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNMB4-201ENST00000258111 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
KCNMB4-201ENST00000258111 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNMB4-201ENST00000258111 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.16■■□□□ 1.62
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KCNMB4-201ENST00000258111 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.13■■□□□ 1.61
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KCNMB4-201ENST00000258111 NPHP1O15259 732 aa25.12■■□□□ 1.61
KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC184Q52MB2 194 aa25.12■■□□□ 1.61
KCNMB4-201ENST00000258111 STK31Q9BXU1 1019 aa25.12■■□□□ 1.61
KCNMB4-201ENST00000258111 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.11■■□□□ 1.61
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KCNMB4-201ENST00000258111 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.1■■□□□ 1.61
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KCNMB4-201ENST00000258111 DAPK1P53355 1430 aa25.09■■□□□ 1.61
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KCNMB4-201ENST00000258111 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.08■■□□□ 1.61
KCNMB4-201ENST00000258111 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
KCNMB4-201ENST00000258111 TPM2P07951 284 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNMB4-201ENST00000258111 PKNOX2Q96KN3 472 aa25.07■■□□□ 1.6
KCNMB4-201ENST00000258111 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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KCNMB4-201ENST00000258111 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
KCNMB4-201ENST00000258111 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.04■■□□□ 1.6
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KCNMB4-201ENST00000258111 NUCB2P80303 420 aa25.03■■□□□ 1.6
KCNMB4-201ENST00000258111 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.03■■□□□ 1.6
KCNMB4-201ENST00000258111 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
KCNMB4-201ENST00000258111 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.01■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.01■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.01■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 NAIPQ13075 1403 aa25■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 KIF16BQ96L93 1317 aa25■■□□□ 1.59
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KCNMB4-201ENST00000258111 ROCK1Q13464 1354 aa24.99■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 MAP3K1Q13233 1512 aa24.99■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.98■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 PANK1Q8TE04 598 aa24.98■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.97■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 RAPGEF3O95398 923 aa24.97■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 REC8O95072 547 aa24.96■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 PDE3AQ14432 1141 aa24.96■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.96■■□□□ 1.59
KCNMB4-201ENST00000258111 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.95■■□□□ 1.58
KCNMB4-201ENST00000258111 ARHGEF11O15085 1522 aa24.94■■□□□ 1.58
KCNMB4-201ENST00000258111 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
KCNMB4-201ENST00000258111 RUNDC1Q96C34 613 aa24.94■■□□□ 1.58
KCNMB4-201ENST00000258111 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
KCNMB4-201ENST00000258111 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.94■■□□□ 1.58
KCNMB4-201ENST00000258111 TPM4P67936 248 aa24.93■■□□□ 1.58
KCNMB4-201ENST00000258111 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
KCNMB4-201ENST00000258111 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.91■■□□□ 1.58
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KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.9■■□□□ 1.58
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KCNMB4-201ENST00000258111 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
KCNMB4-201ENST00000258111 MCTP1Q6DN14 999 aa24.89■■□□□ 1.58
KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC39Q9UFE4 941 aa24.88■■□□□ 1.57
KCNMB4-201ENST00000258111 LNPKQ9C0E8 428 aa24.87■■□□□ 1.57
KCNMB4-201ENST00000258111 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.87■■□□□ 1.57
KCNMB4-201ENST00000258111 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
KCNMB4-201ENST00000258111 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.87■■□□□ 1.57
KCNMB4-201ENST00000258111 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
KCNMB4-201ENST00000258111 GRPEL1Q9HAV7 217 aa24.86■■□□□ 1.57
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