RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 ZFYVE9O95405 1425 aa22.75■■□□□ 1.23
CCL25-201ENST00000253451 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.75■■□□□ 1.23
CCL25-201ENST00000253451 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.75■■□□□ 1.23
CCL25-201ENST00000253451 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
CCL25-201ENST00000253451 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
CCL25-201ENST00000253451 HSPA2P54652 639 aa22.71■■□□□ 1.23
CCL25-201ENST00000253451 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.7■■□□□ 1.22
CCL25-201ENST00000253451 MYOM2P54296 1465 aa22.7■■□□□ 1.22
CCL25-201ENST00000253451 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCL25-201ENST00000253451 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CCL25-201ENST00000253451 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.68■■□□□ 1.22
CCL25-201ENST00000253451 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.67■■□□□ 1.22
CCL25-201ENST00000253451 IQGAP1P46940 1657 aa22.65■■□□□ 1.22
CCL25-201ENST00000253451 LTKP29376 864 aa22.65■■□□□ 1.22
CCL25-201ENST00000253451 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.65■■□□□ 1.22
CCL25-201ENST00000253451 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.64■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.64■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 STRCQ7RTU9 1775 aa22.63■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.63■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.62■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 EID1Q9Y6B2 187 aa22.61■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.6■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 PIK3C2GO75747 1445 aa22.6■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.6■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.6■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.6■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.59■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 CERKQ8TCT0 537 aa22.59■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.59■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CCL25-201ENST00000253451 MED14O60244 1454 aa22.57■■□□□ 1.2
CCL25-201ENST00000253451 LAMC1P11047 1609 aa22.57■■□□□ 1.2
CCL25-201ENST00000253451 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.57■■□□□ 1.2
CCL25-201ENST00000253451 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CCL25-201ENST00000253451 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.54■■□□□ 1.2
CCL25-201ENST00000253451 ALKQ9UM73 1620 aa22.54■■□□□ 1.2
CCL25-201ENST00000253451 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.54■■□□□ 1.2
CCL25-201ENST00000253451 STAC3Q96MF2 364 aa22.54■■□□□ 1.2
CCL25-201ENST00000253451 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.54■■□□□ 1.2
CCL25-201ENST00000253451 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.53■■□□□ 1.2
CCL25-201ENST00000253451 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.52■■□□□ 1.2
CCL25-201ENST00000253451 DIP2AQ14689 1571 aa22.52■■□□□ 1.2
CCL25-201ENST00000253451 BCANQ96GW7 911 aa22.51■■□□□ 1.19
CCL25-201ENST00000253451 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.49■■□□□ 1.19
CCL25-201ENST00000253451 SOCS7O14512 581 aa22.48■■□□□ 1.19
CCL25-201ENST00000253451 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.48■■□□□ 1.19
CCL25-201ENST00000253451 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.47■■□□□ 1.19
CCL25-201ENST00000253451 ADGRB1O14514 1584 aa22.46■■□□□ 1.19
CCL25-201ENST00000253451 ILDR2Q71H61 639 aa22.46■■□□□ 1.19
CCL25-201ENST00000253451 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CCL25-201ENST00000253451 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CCL25-201ENST00000253451 METP08581 1390 aa22.43■■□□□ 1.18
CCL25-201ENST00000253451 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.42■■□□□ 1.18
CCL25-201ENST00000253451 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CCL25-201ENST00000253451 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCL25-201ENST00000253451 TBX22Q9Y458 520 aa22.4■■□□□ 1.18
CCL25-201ENST00000253451 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCL25-201ENST00000253451 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.39■■□□□ 1.17
CCL25-201ENST00000253451 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.39■■□□□ 1.17
CCL25-201ENST00000253451 PTPRUQ92729 1446 aa22.39■■□□□ 1.17
CCL25-201ENST00000253451 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.38■■□□□ 1.17
CCL25-201ENST00000253451 NWD1Q149M9 1564 aa22.38■■□□□ 1.17
CCL25-201ENST00000253451 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.37■■□□□ 1.17
CCL25-201ENST00000253451 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CCL25-201ENST00000253451 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CCL25-201ENST00000253451 PIK3R4Q99570 1358 aa22.35■■□□□ 1.17
CCL25-201ENST00000253451 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.34■■□□□ 1.17
CCL25-201ENST00000253451 CPS1P31327 1500 aa22.34■■□□□ 1.17
CCL25-201ENST00000253451 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CCL25-201ENST00000253451 STK26Q9P289 416 aa22.32■■□□□ 1.16
CCL25-201ENST00000253451 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.31■■□□□ 1.16
CCL25-201ENST00000253451 TECPR2O15040 1411 aa22.31■■□□□ 1.16
CCL25-201ENST00000253451 DLC1Q96QB1 1528 aa22.3■■□□□ 1.16
CCL25-201ENST00000253451 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CCL25-201ENST00000253451 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.28■■□□□ 1.16
CCL25-201ENST00000253451 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CCL25-201ENST00000253451 ABCC11Q96J66 1382 aa22.27■■□□□ 1.16
CCL25-201ENST00000253451 KCNA6P17658 529 aa22.27■■□□□ 1.16
CCL25-201ENST00000253451 PTCH1Q13635 1447 aa22.27■■□□□ 1.16
CCL25-201ENST00000253451 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.27■■□□□ 1.16
CCL25-201ENST00000253451 USP47Q96K76 1375 aa22.26■■□□□ 1.15
CCL25-201ENST00000253451 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.26■■□□□ 1.15
CCL25-201ENST00000253451 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.26■■□□□ 1.15
CCL25-201ENST00000253451 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.23■■□□□ 1.15
CCL25-201ENST00000253451 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CCL25-201ENST00000253451 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.22■■□□□ 1.15
CCL25-201ENST00000253451 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.21■■□□□ 1.15
CCL25-201ENST00000253451 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.2■■□□□ 1.14
CCL25-201ENST00000253451 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CCL25-201ENST00000253451 PRAM1Q96QH2 718 aa22.2■■□□□ 1.14
CCL25-201ENST00000253451 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.19■■□□□ 1.14
CCL25-201ENST00000253451 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCL25-201ENST00000253451 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.17■■□□□ 1.14
CCL25-201ENST00000253451 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CCL25-201ENST00000253451 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
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