RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.52■■□□□ 1.84
PRRT1-201ENST00000211413 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.51■■□□□ 1.83
PRRT1-201ENST00000211413 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.51■■□□□ 1.83
PRRT1-201ENST00000211413 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PRRT1-201ENST00000211413 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.5■■□□□ 1.83
PRRT1-201ENST00000211413 LTKP29376 864 aa26.48■■□□□ 1.83
PRRT1-201ENST00000211413 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
PRRT1-201ENST00000211413 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.48■■□□□ 1.83
PRRT1-201ENST00000211413 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.47■■□□□ 1.83
PRRT1-201ENST00000211413 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.47■■□□□ 1.83
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.46■■□□□ 1.83
PRRT1-201ENST00000211413 ZFYVE9O95405 1425 aa26.45■■□□□ 1.82
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PRRT1-201ENST00000211413 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PRRT1-201ENST00000211413 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PRRT1-201ENST00000211413 MYOM2P54296 1465 aa26.43■■□□□ 1.82
PRRT1-201ENST00000211413 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.43■■□□□ 1.82
PRRT1-201ENST00000211413 HSPA2P54652 639 aa26.42■■□□□ 1.82
PRRT1-201ENST00000211413 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PRRT1-201ENST00000211413 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.41■■□□□ 1.82
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.39■■□□□ 1.82
PRRT1-201ENST00000211413 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.39■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 PIK3C2GO75747 1445 aa26.38■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 BCANQ96GW7 911 aa26.38■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.36■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.35■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.35■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 SLIT1O75093 1534 aa26.35■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 STAC3Q96MF2 364 aa26.35■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 EID1Q9Y6B2 187 aa26.34■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.33■■□□□ 1.81
PRRT1-201ENST00000211413 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.32■■□□□ 1.8
PRRT1-201ENST00000211413 IQGAP1P46940 1657 aa26.3■■□□□ 1.8
PRRT1-201ENST00000211413 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
PRRT1-201ENST00000211413 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.3■■□□□ 1.8
PRRT1-201ENST00000211413 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PRRT1-201ENST00000211413 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.29■■□□□ 1.8
PRRT1-201ENST00000211413 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.29■■□□□ 1.8
PRRT1-201ENST00000211413 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PRRT1-201ENST00000211413 ALKQ9UM73 1620 aa26.28■■□□□ 1.8
PRRT1-201ENST00000211413 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PRRT1-201ENST00000211413 STK26Q9P289 416 aa26.27■■□□□ 1.8
PRRT1-201ENST00000211413 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.25■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.24■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.24■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.24■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 METP08581 1390 aa26.24■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 USP47Q96K76 1375 aa26.24■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.23■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.23■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.23■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 ADGRB1O14514 1584 aa26.22■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.21■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.2■■□□□ 1.79
PRRT1-201ENST00000211413 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
PRRT1-201ENST00000211413 LAMC1P11047 1609 aa26.16■■□□□ 1.78
PRRT1-201ENST00000211413 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
PRRT1-201ENST00000211413 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
PRRT1-201ENST00000211413 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
PRRT1-201ENST00000211413 MED14O60244 1454 aa26.14■■□□□ 1.77
PRRT1-201ENST00000211413 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PRRT1-201ENST00000211413 STRCQ7RTU9 1775 aa26.12■■□□□ 1.77
PRRT1-201ENST00000211413 PTPRUQ92729 1446 aa26.12■■□□□ 1.77
PRRT1-201ENST00000211413 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PRRT1-201ENST00000211413 TBX22Q9Y458 520 aa26.11■■□□□ 1.77
PRRT1-201ENST00000211413 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.1■■□□□ 1.77
PRRT1-201ENST00000211413 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.06■■□□□ 1.76
PRRT1-201ENST00000211413 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.06■■□□□ 1.76
PRRT1-201ENST00000211413 PRAM1Q96QH2 718 aa26.06■■□□□ 1.76
PRRT1-201ENST00000211413 TESK2Q96S53 571 aa26.06■■□□□ 1.76
PRRT1-201ENST00000211413 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PRRT1-201ENST00000211413 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PRRT1-201ENST00000211413 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PRRT1-201ENST00000211413 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.04■■□□□ 1.76
PRRT1-201ENST00000211413 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PRRT1-201ENST00000211413 KCNA6P17658 529 aa26.02■■□□□ 1.76
PRRT1-201ENST00000211413 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PRRT1-201ENST00000211413 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.01■■□□□ 1.75
PRRT1-201ENST00000211413 POGKQ9P215 609 aa26.01■■□□□ 1.75
PRRT1-201ENST00000211413 ABCC11Q96J66 1382 aa26■■□□□ 1.75
PRRT1-201ENST00000211413 DIP2AQ14689 1571 aa25.99■■□□□ 1.75
PRRT1-201ENST00000211413 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PRRT1-201ENST00000211413 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.99■■□□□ 1.75
PRRT1-201ENST00000211413 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.98■■□□□ 1.75
PRRT1-201ENST00000211413 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PRRT1-201ENST00000211413 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.97■■□□□ 1.75
PRRT1-201ENST00000211413 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PRRT1-201ENST00000211413 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.95■■□□□ 1.74
PRRT1-201ENST00000211413 MIER1Q8N108 512 aa25.94■■□□□ 1.74
PRRT1-201ENST00000211413 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.92■■□□□ 1.74
PRRT1-201ENST00000211413 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.92■■□□□ 1.74
PRRT1-201ENST00000211413 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PRRT1-201ENST00000211413 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PRRT1-201ENST00000211413 TECPR2O15040 1411 aa25.91■■□□□ 1.74
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