RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105041.9

H2-Q1-202, Transcript of Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2-Q1, Length 1,954 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Myom2Q14BI5 1463 aa16.46■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa16.45■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Hfm1D3Z4R1 1434 aa16.45■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tecpr2Q3UH45 1423 aa16.45■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Csrnp3P59055 597 aa16.44■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Os9Q8K2C7 672 aa16.44■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 RictorQ6QI06 1708 aa16.41■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 AatkQ80YE4 1365 aa16.41■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kdm2aP59997 1161 aa16.41■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa16.41■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Skint5A7XUY5 1461 aa16.41■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Uggt1Q6P5E4 1551 aa16.4■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ncoa1P70365 1447 aa16.38■□□□□ 0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Aplp2Q06335 707 aa16.37■□□□□ 0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa16.37■□□□□ 0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm20521D3Z5F7 333 aa16.36■□□□□ 0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mroh1E0CZ22 1640 aa16.35■□□□□ 0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rims1Q99NE5 1463 aa16.35■□□□□ 0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zbtb4Q5F293 982 aa16.35■□□□□ 0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa16.34■□□□□ 0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rock2P70336 1388 aa16.32■□□□□ 0.2
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Myo3aQ8K3H5 1613 aa16.32■□□□□ 0.2
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kif13aQ9EQW7 1749 aa16.31■□□□□ 0.2
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fan1Q69ZT1 1020 aa16.31■□□□□ 0.2
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Myt1Q8CFC2 1127 aa16.29■□□□□ 0.2
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Atp1b4Q99ME6 356 aa16.29■□□□□ 0.2
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc24a1Q91WD8 1130 aa16.29■□□□□ 0.2
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa16.28■□□□□ 0.2
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Srcin1Q9QWI6 1250 aa16.27■□□□□ 0.2
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa16.27■□□□□ 0.2
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Setd1aE9PYH6 1716 aa16.27■□□□□ 0.2
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 AU022751B1B0V2 589 aa16.27■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa16.26■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 P3h3Q8CG70 732 aa16.26■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Naip7Q9JIB3 1402 aa16.25■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PtprmP28828 1452 aa16.25■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Stard8Q8K031 1019 aa16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Usp40Q8BWR4 1235 aa16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa16.24■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Plekhg5Q66T02 1073 aa16.23■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc52a2Q9D8F3 450 aa16.23■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 MyclP10166 368 aa16.22■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Shq1Q7TMX5 569 aa16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nphp4P59240 1425 aa16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Lrrc7Q80TE7 1490 aa16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Txndc2Q6P902 515 aa16.2■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dip2bQ3UH60 1574 aa16.19■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm13695A2AK44 830 aa16.18■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 IqubQ8CDK3 788 aa16.18■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pola1P33609 1465 aa16.18■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa16.18■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 DnmbpQ6TXD4 1580 aa16.17■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Arhgef28P97433 1693 aa16.17■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Stag3O70576 1240 aa16.17■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Alpk3Q924C5 1678 aa16.17■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 CenpbP27790 599 aa16.17■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Psme1P97371 249 aa16.17■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PalldQ9ET54 1408 aa16.16■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PplQ9R269 1755 aa16.16■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa16.15■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Q9D9H8 365 aa16.15■□□□□ 0.18
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Stk26Q99JT2 416 aa16.14■□□□□ 0.17
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa16.14■□□□□ 0.17
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ift172Q6VH22 1749 aa16.11■□□□□ 0.17
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Stra8P70278 393 aa16.1■□□□□ 0.17
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dip2aQ8BWT5 1523 aa16.08■□□□□ 0.17
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 MaddQ80U28 1577 aa16.08■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tmf1B9EKI3 1091 aa16.07■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 CenpjQ569L8 1344 aa16.07■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 PrxO55103 1391 aa16.07■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sbno1Q689Z5 1390 aa16.07■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa16.06■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc4a1apE9PX68 744 aa16.06■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pank3Q8R2W9 370 aa16.06■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Bcl9Q9D219 1425 aa16.06■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Asxl2Q8BZ32 1370 aa16.06■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Topaz1E5FYH1 1653 aa16.04■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cep170bQ80U49 1574 aa16.03■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Inpp5dQ9ES52 1191 aa16.02■□□□□ 0.16
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Plekhg1F6S200 1446 aa16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.1 ms