RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Neo1P97798 1493 aa8.67□□□□□ -1.02
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trappc8E9PWG2 1437 aa8.67□□□□□ -1.02
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmf1B9EKI3 1091 aa8.66□□□□□ -1.02
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srcin1Q9QWI6 1250 aa8.61□□□□□ -1.03
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hecw1Q8K4P8 1604 aa8.61□□□□□ -1.03
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa8.61□□□□□ -1.03
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kdm2aP59997 1161 aa8.6□□□□□ -1.03
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plcd4Q8K3R3 807 aa8.6□□□□□ -1.03
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rusc2Q80U22 1514 aa8.6□□□□□ -1.03
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mre11Q61216 706 aa8.59□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc30Q8BVF4 654 aa8.59□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcaf11Q91VU6 549 aa8.59□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa8.58□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp19Q3UJD6 1360 aa8.58□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map3k5O35099 1380 aa8.58□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ShprhQ7TPQ3 1674 aa8.58□□□□□ -1.04
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col17a1Q07563 1470 aa8.57□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppm1gQ61074 542 aa8.57□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abcc6Q9R1S7 1498 aa8.57□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sall3Q62255 1320 aa8.57□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim30dE9PWL0 497 aa8.57□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tspyl2Q7TQI8 677 aa8.57□□□□□ -1.04
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abcc3B2RX12 1523 aa8.55□□□□□ -1.04
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gas2l2Q5SSG4 860 aa8.55□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abca17E9PX95 1733 aa8.55□□□□□ -1.04
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Clrn3-201ENSMUST00000053716 AnkarA2RT91 1465 aa8.54□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Uggt2E9Q4X2 1504 aa8.54□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prdm16A2A935 1275 aa8.54□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pank1Q8K4K6 548 aa8.54□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Golga2Q921M4 999 aa8.54□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abcc1O35379 1528 aa8.53□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NhsB1AV60 1647 aa8.53□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20521D3Z5F7 333 aa8.53□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ArxO35085 564 aa8.53□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Amer1Q7TS75 1132 aa8.53□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myo5cE9Q1F5 1742 aa8.53□□□□□ -1.04
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
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