RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ipo9Q91YE6 1041 aa29,24■■■□□ 2,27
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc6Q9R1S7 1498 aa29,23■■■□□ 2,27
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa29,22■■■□□ 2,27
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP29,22■■■□□ 2,27
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam184bQ0KK56 942 aa29,2■■■□□ 2,27
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif16bB1AVY7 1312 aa29,2■■■□□ 2,26
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa29,2■■■□□ 2,26
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Os9Q8K2C7 672 aa29,19■■■□□ 2,26
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa29,14■■■□□ 2,26
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm20521D3Z5F7 333 aa29,13■■■□□ 2,25
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myo5cE9Q1F5 1742 aa29,12■■■□□ 2,25
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Uggt2E9Q4X2 1504 aa29,12■■■□□ 2,25
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TnikP83510 1323 aa29,11■■■□□ 2,25
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif7B7ZNG0 1348 aa29,05■■■□□ 2,24
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ttc21bQ0HA38 1315 aa29,04■■■□□ 2,24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa29,04■■■□□ 2,24
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ttc41Q692V3 1318 aa29,03■■■□□ 2,24
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atf7ipQ7TT18 1306 aa29,02■■■□□ 2,24
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 B4galnt3Q6L8S8 986 aa29■■■□□ 2,23
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Col17a1Q07563 1470 aa29■■■□□ 2,23
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa28,99■■■□□ 2,23
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa28,98■■■□□ 2,23
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rwdd1Q9CQK7 243 aa28,98■■■□□ 2,23
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nos1Q9Z0J4 1429 aa28,98■■■□□ 2,23
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fndc1E9Q043 1732 aa28,98■■■□□ 2,23
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arid3cA6PWV5 409 aa28,98■■■□□ 2,23
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nlrp6Q91WS2 869 aa28,98■■■□□ 2,23
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Neurod2Q62414 383 aa28,97■■■□□ 2,23
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfyve16Q80U44 1528 aa28,97■■■□□ 2,23
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP28,96■■■□□ 2,23
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa28,96■■■□□ 2,23
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myo3aQ8K3H5 1613 aa28,96■■■□□ 2,23
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP28,95■■■□□ 2,23
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abca9Q8K449 1623 aa28,95■■■□□ 2,23
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plekhh1Q80TI1 1356 aa28,95■■■□□ 2,23
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lemd3Q9WU40 921 aa28,93■■■□□ 2,22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP28,93■■■□□ 2,22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp19Q3UJD6 1360 aa28,93■■■□□ 2,22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa28,92■■■□□ 2,22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dbr1Q923B1 550 aa28,92■■■□□ 2,22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa28,92■■■□□ 2,22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AatkQ80YE4 1365 aa28,9■■■□□ 2,22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cnga1P29974 684 aa28,89■■■□□ 2,22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc30Q8BVF4 654 aa28,89■■■□□ 2,22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa28,88■■■□□ 2,21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP28,88■■■□□ 2,21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abca8aQ8K442 1620 aa28,87■■■□□ 2,21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nphp4P59240 1425 aa28,86■■■□□ 2,21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rims1Q99NE5 1463 aa28,84■■■□□ 2,21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stard8Q8K031 1019 aa28,84■■■□□ 2,21
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Golga2Q921M4 999 aa28,82■■■□□ 2,2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PtprtQ99M80 1454 aa28,82■■■□□ 2,2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prex1Q69ZK0 1650 aa28,82■■■□□ 2,2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa28,81■■■□□ 2,2
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP28,8■■■□□ 2,2
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gas2l2Q5SSG4 860 aa28,8■■■□□ 2,2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 EspnQ9ET47 871 aa28,78■■■□□ 2,2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chmp5Q9D7S9 219 aa28,77■■■□□ 2,2
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa28,76■■■□□ 2,19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa28,75■■■□□ 2,19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Uspl1Q3ULM6 1089 aa28,74■■■□□ 2,19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Talpid3E9PV87 1520 aa28,73■■■□□ 2,19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tspyl2Q7TQI8 677 aa28,73■■■□□ 2,19
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 DnmbpQ6TXD4 1580 aa28,71■■■□□ 2,19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa28,7■■■□□ 2,19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP28,7■■■□□ 2,19
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Efcab6Q6P1E8 1516 aa28,7■■■□□ 2,18
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trpm1Q2TV84 1622 aa28,7■■■□□ 2,18
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa28,69■■■□□ 2,18
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stag3O70576 1240 aa28,69■■■□□ 2,18
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CanxP35564 591 aaKnown RBP28,69■■■□□ 2,18
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myom2Q14BI5 1463 aa28,67■■■□□ 2,18
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