RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Uggt2E9Q4X2 1504 aa28.99■■■□□ 2.23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NeflP08551 543 aa28.99■■■□□ 2.23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abcc6Q9R1S7 1498 aa28.98■■■□□ 2.23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Srcin1Q9QWI6 1250 aa28.94■■■□□ 2.22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa28.93■■■□□ 2.22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Myo5cE9Q1F5 1742 aa28.93■■■□□ 2.22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa28.91■■■□□ 2.22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa28.9■■■□□ 2.22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc4a1apE9PX68 744 aa28.9■■■□□ 2.22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kif16bB1AVY7 1312 aa28.89■■■□□ 2.22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atf7ipQ7TT18 1306 aa28.89■■■□□ 2.22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc27Q3V036 639 aa28.89■■■□□ 2.22
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Esx1O88933 382 aa28.89■■■□□ 2.21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam184bQ0KK56 942 aa28.88■■■□□ 2.21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zfyve16Q80U44 1528 aa28.83■■■□□ 2.21
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf608Q56A10 1511 aa28.82■■■□□ 2.2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Erich6D3Z6S9 713 aa28.8■■■□□ 2.2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sall3Q62255 1320 aa28.8■■■□□ 2.2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa28.8■■■□□ 2.2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kdm2aP59997 1161 aa28.79■■■□□ 2.2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Col17a1Q07563 1470 aa28.79■■■□□ 2.2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fndc1E9Q043 1732 aa28.79■■■□□ 2.2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa28.79■■■□□ 2.2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CrbnQ8C7D2 445 aa28.78■■■□□ 2.2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa28.78■■■□□ 2.2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nos1Q9Z0J4 1429 aa28.77■■■□□ 2.2
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Igf1rQ60751 1373 aa28.76■■■□□ 2.19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plekhh1Q80TI1 1356 aa28.76■■■□□ 2.19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Iqgap3F8VQ29 1632 aa28.75■■■□□ 2.19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttll13A4Q9F6 804 aa28.73■■■□□ 2.19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abca8aQ8K442 1620 aa28.72■■■□□ 2.19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abca6Q8K441 1624 aa28.71■■■□□ 2.19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abca9Q8K449 1623 aa28.71■■■□□ 2.19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa28.71■■■□□ 2.19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zmym3Q9JLM4 1370 aa28.7■■■□□ 2.19
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stard8Q8K031 1019 aa28.7■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm20521D3Z5F7 333 aa28.69■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rwdd1Q9CQK7 243 aa28.69■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ErbinQ80TH2 1402 aa28.69■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttc21bQ0HA38 1315 aa28.69■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kif3bQ61771 747 aa28.69■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rims1Q99NE5 1463 aa28.68■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa28.68■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Myo3aQ8K3H5 1613 aa28.67■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nphp4P59240 1425 aa28.67■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa28.67■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kif7B7ZNG0 1348 aa28.67■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Usp19Q3UJD6 1360 aa28.67■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Os9Q8K2C7 672 aa28.64■■■□□ 2.18
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trpm1Q2TV84 1622 aa28.63■■■□□ 2.17
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DnmbpQ6TXD4 1580 aa28.62■■■□□ 2.17
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Usp40Q8BWR4 1235 aa28.61■■■□□ 2.17
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa28.59■■■□□ 2.17
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa28.59■■■□□ 2.17
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa28.59■■■□□ 2.17
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Talpid3E9PV87 1520 aa28.59■■■□□ 2.17
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa28.58■■■□□ 2.17
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa28.58■■■□□ 2.17
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prex1Q69ZK0 1650 aa28.58■■■□□ 2.17
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Iqcf3Q9D498 203 aa28.57■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 AatkQ80YE4 1365 aa28.57■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa28.57■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc30Q8BVF4 654 aa28.57■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nlrp6Q91WS2 869 aa28.56■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Myom2Q14BI5 1463 aa28.56■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ChgaP26339 463 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dcaf11Q91VU6 549 aa28.55■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stk24Q99KH8 431 aa28.55■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fan1Q69ZT1 1020 aa28.54■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 EspnQ9ET47 871 aa28.54■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lemd3Q9WU40 921 aa28.54■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Uggt1Q6P5E4 1551 aa28.53■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 B4galnt3Q6L8S8 986 aa28.52■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa28.51■■■□□ 2.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nkx1-2P42580 305 aa28.5■■■□□ 2.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Efcab6Q6P1E8 1516 aa28.5■■■□□ 2.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Depdc5P61460 1591 aa28.48■■■□□ 2.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Golga2Q921M4 999 aa28.48■■■□□ 2.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Uspl1Q3ULM6 1089 aa28.46■■■□□ 2.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 KdrP35918 1367 aa28.45■■■□□ 2.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ralbp1Q62172 648 aa28.45■■■□□ 2.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Neurod2Q62414 383 aa28.45■■■□□ 2.15
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Chmp5Q9D7S9 219 aa28.45■■■□□ 2.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Apbb1Q9QXJ1 710 aa28.44■■■□□ 2.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PtprtQ99M80 1454 aa28.43■■■□□ 2.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Akap12Q9WTQ5 1684 aa28.43■■■□□ 2.14
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tecpr2Q3UH45 1423 aa28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43 ms