RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W CSM4Q08955 156 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W POG1P40473 351 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W GPI15P53961 229 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YMR279CQ03263 540 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YKL183C-AQ3E765 70 aa2.37□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W HRR25P29295 494 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W CLD1P53264 445 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W BIO4P53630 237 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W AME1P38313 324 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W AIM18P38884 321 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W DCN1Q12395 269 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YCL012CQ8J0M4 134 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YLR422WQ06409 1932 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YCR007CP25354 239 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YKL162CP36052 402 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ECM8P38246 354 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YHK8P38776 514 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W IKI1P38874 309 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YPR053CQ6Q5F3 151 aa2.36□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W BAR1P12630 587 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ACP1P32463 125 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W PDC2P32896 925 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W VAM7P32912 316 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W FLO10P36170 1169 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YPK3P38070 525 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W EFM1P38732 585 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YFL015CP43578 164 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W LST7P53237 242 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YMR254CQ04838 102 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ARC18Q05933 178 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ERV2Q12284 196 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RPS13P05756 151 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W IFM1P25038 676 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W AGE2P40529 298 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W HAL1Q01766 294 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W PLP1Q04004 230 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W PCL9Q12477 304 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W PUT1P09368 476 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YHR180WP38868 163 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SYG1P40528 902 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SFH5P47008 294 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YJR154WP47181 346 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W NUP57P48837 541 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YMR317WQ04893 1140 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W EXG1P23776 448 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SDS24P38314 527 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W MIG3P39943 394 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YML108WQ03759 105 aa2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ATP6P00854 259 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YPT10P38146 199 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W DER1P38307 211 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W NSG1P38837 291 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YND1P40009 630 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YPI1P43587 155 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W SNX41Q04053 625 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W TIM18Q08749 192 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ORT1Q12375 292 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W EAF3Q12432 401 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W CDC39P25655 2108 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W TEL1P38110 2787 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W AAT2P23542 418 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W CDC10P25342 322 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W HOM6P31116 359 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W COX14P39103 70 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W PAC2P39937 518 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YJR056CP47115 236 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W MMS2P53152 137 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W POP6P53218 158 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W IZH2Q12442 317 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W YOR343CQ12484 108 aa2.34□□□□□ -2.03
SIN3YOL004W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W SEC22P22214 214 aa2.34□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W TIR2P33890 251 aa2.34□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W TOD6P34219 525 aa2.34□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W KTI12P34253 313 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W JEN1P36035 616 aa2.34□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YGR210CP42942 411 aa2.34□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RHO4Q00246 291 aa2.34□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PST2Q12335 198 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W IST2P38250 946 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W STP2P38704 541 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W TOS8P53147 276 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W AFT2Q08957 416 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W YLR053CQ12026 108 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W RPN13O13563 156 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W CHO1P08456 276 aa2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
SIN3YOL004W PHD1P36093 366 aa2.33□□□□□ -2.04
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