RNA–Protein interactions for RNA: YML061C

PIF1, Transcript of DNA helicase, potent G-quadruplex DNA binder/unwinder, yeast

Gene PIF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIF1	YML061C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YNL184C	P53876	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TIM44	Q01852	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	SWM1	Q12379	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	COX9	P07255	59 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TRS65	P32893	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	RIB5	P38145	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TRS20	P38334	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	OXA1	P39952	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	SHO1	P40073	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	VHS2	P40463	436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YIR035C	P40579	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TRI1	Q05024	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	MIM1	Q08176	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	WTM2	Q12206	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	HTB2	P02294	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	CUP2	P15315	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	EHD3	P28817	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	PHD1	P36093	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	NAT2	P37293	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	MCM22	P47167	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	CCC1	P47818	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YGL114W	P53134	725 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TNA1	P53322	534 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
PIF1	YML061C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	SCP1	Q08873	200 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	MCP1	Q12106	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	FCY22	Q12119	530 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	FRE7	Q12333	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	AGC1	Q12482	902 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YLR302C	O13544	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	ELO2	P25358	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	SNC2	P33328	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	UMP1	P38293	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YML018C	Q03730	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	RXT3	Q07458	294 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	COQ10	Q08058	207 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TFC7	Q12415	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	FSH3	Q99369	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	CDC7	P06243	507 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	CHO1	P08456	276 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	PUT1	P09368	476 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YKL162C	P36052	402 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	FRM2	P37261	193 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YCH1	P42937	148 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	CTK2	P46962	323 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	CUZ1	P53899	274 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RNH201	P53942	307 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YML053C	Q04978	212 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	CRR1	Q05790	422 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	ANT1	Q06497	328 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.84	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	REP2	P03872	296 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YMR31	P19955	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	PDC2	P32896	925 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YBR220C	P38318	560 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	LAG1	P38703	411 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RFC2	P40348	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YGR149W	P48236	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	ARL3	Q02804	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	TPP1	Q03796	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	DIC1	Q06143	298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	TRM13	Q12383	476 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	COX5B	P00425	151 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	CNB1	P25296	175 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	GPI16	P38875	610 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YIL169C	P40442	995 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	SYS1	P41544	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	GLC8	P41818	229 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YJL016W	P47072	561 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	UFD1	P53044	361 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	CAF40	P53829	373 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	YLR152C	P54072	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	TSA2	Q04120	196 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	MIX14	Q04341	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	IRC19	Q07843	230 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PIF1	YML061C	UBC12	P52491	188 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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