RNA–Protein interactions for RNA: YHR085W

IPI1, Transcript of Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes, yeast

Gene IPI1, Length 1,005 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IPI1	YHR085W	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	HHT1	P61830	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YMR181C	Q03231	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	MRX8	Q05473	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	ASR1	Q06834	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	FIT3	Q08907	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	IES3	Q12345	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	IZH2	Q12442	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	SIR2	P06700	562 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	COX9	P07255	59 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	SGA1	P08019	549 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	AGA2	P32781	87 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	GPX2	P38143	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	AVT7	P40501	490 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	CCC1	P47818	322 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	SIP18	P50263	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YGL204C	P53089	101 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	MTM1	P53320	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	BUD25	P85052	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	FMP42	Q04991	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	RTT103	Q05543	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	NNT1	Q05874	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	ACB1	P31787	87 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	DOA4	P32571	926 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YKR015C	P36111	568 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	FRM2	P37261	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	GEP4	P38812	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	TIR3	P40552	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	GDS1	P41913	522 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	GAL83	Q04739	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	NDE2	Q07500	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	ATG41	Q12048	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	CAP2	P13517	287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YCR022C	P25620	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	RIB5	P38145	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	DDI1	P40087	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	FLX1	P40464	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YIL029C	P40538	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	DOC1	P53068	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	FMP48	P53233	369 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	LST7	P53237	242 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	ATG17	Q06410	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	GPN3	Q06543	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	HIS3	P06633	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	CDC23	P16522	626 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	PAU2	P32612	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	TIR2	P33890	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	CLG1	P35190	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YBR220C	P38318	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YHK8	P38776	514 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	COX16	P47081	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	CAF40	P53829	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YLR152C	P54072	576 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	SED1	Q01589	338 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	SNA4	Q07549	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	MSW1	P04803	379 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	MSI1	P13712	422 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	MRPS28	P21771	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	SFK1	P35735	353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	KEG1	P43614	200 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	MRX5	P47007	382 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YGL159W	P53110	370 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	MRH4	P53166	561 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	AAH1	P53909	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IPI1	YHR085W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IPI1	YHR085W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IPI1	YHR085W	AHC2	P25649	128 aa		4.52	□□□□□ -1.69
IPI1	YHR085W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
IPI1	YHR085W	CLB6	P32943	380 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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